Tecnología de análisis para ITU disminuye tiempo de detección de manera significativa
Por el equipo editorial de LabMedica en español Actualizado el 02 Nov 2016 |
Imagen: El dispositivo de secuenciación MinION nanopore (Fotografía cortesía de Oxford Nanopore Technologies).
La mayoría de las infecciones del tracto urinario (ITU) son casos leves, pero serios que pueden conducir a hospitalización y, en el peor de los casos, las bacterias pueden entrar al torrente sanguíneo causando sepsis urinaria, una enfermedad potencialmente mortal. En este caso los antibióticos son vitales y deben ser administrados inmediatamente.
Entre más rápido se pueda hacer la predicción de si la ITU es causada por un tipo de bacteria altamente resistente, más rápido se puede adaptar el tratamiento. El paciente recibirá un antibiótico que, con toda seguridad, será activo contra el patógeno y el recurso limitado de antibióticos de la sociedad será administrado de mejor manera. Esto ayudará en la lucha contra, la cada vez mayor resistencia a los antibióticos, uno de los mayores retos que la sociedad enfrenta hoy en día.
Unos científicos médicos de la universidad de Anglia Oriental (Norwich, Reino Unido) investigaron si la secuenciación con nanoporos podría acelerar el diagnóstico y el análisis de la resistencia, usando infecciones complicadas del tracto urinario, como un ejemplo. Se enriqueció el ADN bacteriano a partir de orinas clínicas y de cinco orinas sanas a las que se les agregó Escherichia coli multirresistente, las cuales fueron secuenciadas a continuación. Las secuencias fueron analizadas usando bases de datos externas y líneas de producción bioinformáticas. O, de manera alternativa, usando aplicaciones integradas de análisis en tiempo real. Los resultados fueron comparados con los datos obtenidos de Illumina y los fenotipos de resistencia.
El equipo utilizó la secuenciación de nanoporos MinION (Oxford Nanopore Technologies, Oxford, Reino Unido), que identificó correctamente patógenos sin necesidad de cultivo y, entre los 55 genes de resistencia adquiridos detectados en las bacterias cultivadas mediante secuenciación de Illumina, 51 fueron encontrados mediante secuenciación MinION, directamente de las muestras de orina; con tres de cuatro fallas en un procesamiento temprano con baja cobertura del genoma. Las mutaciones que confieren resistencia y las variantes alélicas no fueron identificadas de forma fiable. La secuenciación MinION identificó de manera integral los patógenos y los genes de resistencia adquirida, en la orina, en un plazo de cuatro horas desde la muestra hasta el resultado, un resultado similar al obtenido con la reacción en cadena de la polimerasa (PCR).
Justin O'Grady, PhD, uno de los autores principales, dijo: “Este estudio es el primero en usar la secuenciación MinION para diagnosticar rápidamente los patógenos y la resistencia antimicrobiana en muestras clínicas, sin necesidad de cultivos. Las mejoras en la tecnología secuenciación, los análisis de datos y la preparación de las muestras significa que hemos reducido el tiempo de respuesta a cuatro horas. Obtener los resultados con esta velocidad les permitirá a los médicos ajustar la terapia antimicrobiana muy temprano, inclusive antes de que la segunda dosis sea administrada puesto que los antibióticos son dados una vez cada ocho horas”. El estudio fue publicado en septiembre 25 de 2016 en la revista Journal of Antimicrobial Chemotherapy.
Enlaces relacionados:
Últimas Microbiología noticias
- Nuevos ensayos de hepatitis con marcado CE permite la detección temprana de infecciones
- Prueba de PCR múltiplex identifica el 95 % de los patógenos que causan la sepsis en una hora
- Prueba de bacterias bucales podría predecir la progresión del cáncer de colon
- Firma metabólica unica podría permitir el diagnóstico de sepsis dentro de una hora de la extracción de sangre
- Innovadora plataforma de diagnóstico proporciona resultados de AST con velocidad sin precedentes
- Análisis de sangre predice sepsis e insuficiencia orgánica en niños
- Análisis de sangre para tuberculosis podría detectar millones de propagadores silenciosos
- Un análisis de sangre simple combinado con un modelo de riesgo personalizado mejora el diagnóstico de sepsis
- Nuevo análisis de sangre reduce tiempo de diagnóstico de infecciones por micobacterias no tuberculosas de meses a horas
- Nuevo análisis para tuberculosis podría ampliar acceso a pruebas en países de ingresos bajos y medios
- Prueba rápida diagnostica enfermedades tropicales en horas para tratamiento con antibióticos más rápido
- Pruebas moleculares rápidas permiten tratamiento antibiótico más rápido y específico para neumonía
- Plataforma rápida de PSA proporciona resultados terapéuticos específicos días antes que el estándar de atención actual
- Nuevo método de análisis detecta patógenos en sangre de forma más rápida y precisa al fundir ADN
- Prueba rápida de sepsis ofrece resultados dos días más rápidos
- Diagnóstico rápido portátil por PCR podría detectar gonorrea y susceptibilidad a antibióticos