Mutaciones en cáncer raro causado por asbesto identificadas por secuenciación dirigida
Por el equipo editorial de LabMedica en español Actualizado el 29 Jan 2015 |
Imagen: Una microfotografía de una muestra de citopatología de líquido pleural mostrando un mesotelioma (Fotografía cortesía de Wikimedia Commons).
La secuenciación dirigida, de siguiente generación, una herramienta avanzada para el análisis genómico, ha sido utilizada para identificar los genes asociados con el desarrollo del cáncer raro, el mesotelioma pleural maligno (MPM).
El mesotelioma maligno es una forma rara de cáncer que se desarrolla a partir de células transformadas originarias en el mesotelio, el revestimiento protector que cubre muchos de los órganos internos del cuerpo. Generalmente es causado por la exposición al asbesto. El sitio anatómico más común para el desarrollo del mesotelioma es la pleura (el revestimiento exterior de los pulmones y de la pared torácica interna), pero también puede surgir en el peritoneo (el revestimiento de la cavidad abdominal), el pericardio (el saco que rodea el corazón), o la túnica vaginalis (un saco que rodea los testículos). La tasa de supervivencia de tres años para los pacientes con esta enfermedad es sólo el 8%, dado que la mayoría de los pacientes con MPM son diagnosticados cuando la enfermedad ya se encuentra en una etapa tardía con opciones terapéuticas limitadas.
Investigadores de la Universidad de Turín (Orbassano, Italia) usaron la secuenciación dirigida, de próxima generación, (NGS), un método que determina la identidad y el orden de los nucleótidos en el ADN que comprenden un conjunto específico de genes en lugar de hacer la secuenciación de todo el genoma, para analizar las células tumorales de pacientes con MPM en etapa avanzada.
En este estudio, se analizó retrospectivamente una serie de 123 muestras de tejido, fijadas en formol e incluidas en parafina (FFPE) con anotaciones clínicas, con el kit de biblioteca Ion AmpliSeq Cancer Hotspot Panel v.2 de Life Tecnologies (Carlsbad, CA, EUA), para investigar 50 genes más otros dos; el gen de la proteína asociada a BRCA1-1 (BAP-1) y el gen de la neurofibromatosis-2 (NF2), modificados, con frecuencia, en el MPM.
Los resultados revelaron que las mutaciones se agruparon en dos vías moleculares principales, p53/reparación del ADN y PI3K/AKT (PI3 quinasa/proteína quinasa B). Ciertas mutaciones en los genes PIK3CA, STK11, o TP53 se asociaron con una disminución en el tiempo para la progresión de la enfermedad. Además, hubo una disminución en el tiempo de progresión de la enfermedad y la supervivencia global cuando hubo una acumulación de múltiples mutaciones. Además, una mutación en el gen BAP-1, se correlacionó con la localización nuclear de la proteína BAP-1.
Resumiendo el estudio, los investigadores dijeron: “Nuestros resultados muestran que la NGS es claramente factible a pesar de los retos muy conocidas de ADN genómico fragmentado y de bajo rendimiento aislado a partir del tejido tumoral en FFPE. Nuestros datos no identificaron ninguna mutación específica como un solo gen conductor, como se encuentra en el adenocarcinoma de pulmón, sin embargo nuestros datos sugieren que en el mesotelioma maligno hay una acumulación de varias mutaciones que en sí no promueven el cáncer individualmente, lo que puede explicar la fase de latencia extremadamente larga de esta enfermedad relacionada con el asbesto. Algunas de las mutaciones serán evaluadas adicionalmente en busca de cambios funcionales y podrían ser consideradas cuidadosamente como factores de estratificación para futuros ensayos clínicos que investigan el papel de las terapias dirigidas en el mesotelioma maligno”.
El estudio fue publicado en la edición digital del 15 de diciembre de 2014, de la revista Journal of Thoracic Oncology.
Enlaces relacionados:
University of Torino
Life Technologies
El mesotelioma maligno es una forma rara de cáncer que se desarrolla a partir de células transformadas originarias en el mesotelio, el revestimiento protector que cubre muchos de los órganos internos del cuerpo. Generalmente es causado por la exposición al asbesto. El sitio anatómico más común para el desarrollo del mesotelioma es la pleura (el revestimiento exterior de los pulmones y de la pared torácica interna), pero también puede surgir en el peritoneo (el revestimiento de la cavidad abdominal), el pericardio (el saco que rodea el corazón), o la túnica vaginalis (un saco que rodea los testículos). La tasa de supervivencia de tres años para los pacientes con esta enfermedad es sólo el 8%, dado que la mayoría de los pacientes con MPM son diagnosticados cuando la enfermedad ya se encuentra en una etapa tardía con opciones terapéuticas limitadas.
Investigadores de la Universidad de Turín (Orbassano, Italia) usaron la secuenciación dirigida, de próxima generación, (NGS), un método que determina la identidad y el orden de los nucleótidos en el ADN que comprenden un conjunto específico de genes en lugar de hacer la secuenciación de todo el genoma, para analizar las células tumorales de pacientes con MPM en etapa avanzada.
En este estudio, se analizó retrospectivamente una serie de 123 muestras de tejido, fijadas en formol e incluidas en parafina (FFPE) con anotaciones clínicas, con el kit de biblioteca Ion AmpliSeq Cancer Hotspot Panel v.2 de Life Tecnologies (Carlsbad, CA, EUA), para investigar 50 genes más otros dos; el gen de la proteína asociada a BRCA1-1 (BAP-1) y el gen de la neurofibromatosis-2 (NF2), modificados, con frecuencia, en el MPM.
Los resultados revelaron que las mutaciones se agruparon en dos vías moleculares principales, p53/reparación del ADN y PI3K/AKT (PI3 quinasa/proteína quinasa B). Ciertas mutaciones en los genes PIK3CA, STK11, o TP53 se asociaron con una disminución en el tiempo para la progresión de la enfermedad. Además, hubo una disminución en el tiempo de progresión de la enfermedad y la supervivencia global cuando hubo una acumulación de múltiples mutaciones. Además, una mutación en el gen BAP-1, se correlacionó con la localización nuclear de la proteína BAP-1.
Resumiendo el estudio, los investigadores dijeron: “Nuestros resultados muestran que la NGS es claramente factible a pesar de los retos muy conocidas de ADN genómico fragmentado y de bajo rendimiento aislado a partir del tejido tumoral en FFPE. Nuestros datos no identificaron ninguna mutación específica como un solo gen conductor, como se encuentra en el adenocarcinoma de pulmón, sin embargo nuestros datos sugieren que en el mesotelioma maligno hay una acumulación de varias mutaciones que en sí no promueven el cáncer individualmente, lo que puede explicar la fase de latencia extremadamente larga de esta enfermedad relacionada con el asbesto. Algunas de las mutaciones serán evaluadas adicionalmente en busca de cambios funcionales y podrían ser consideradas cuidadosamente como factores de estratificación para futuros ensayos clínicos que investigan el papel de las terapias dirigidas en el mesotelioma maligno”.
El estudio fue publicado en la edición digital del 15 de diciembre de 2014, de la revista Journal of Thoracic Oncology.
Enlaces relacionados:
University of Torino
Life Technologies
Últimas Diagnóstico Molecular noticias
- Prueba de sangre detecta y monitorea cáncer pulmonar de células pequeñas agresivo
- Ensayo de aprendizaje automático basado en sangre detecta de forma no invasiva el cáncer de ovario
- Ensayo de PCR simple diferencia con precisión entre los subtipos de cáncer de pulmón de células pequeñas
- Enfoque revolucionario de análisis de células T permite detección temprana del cáncer
- Prueba genética única podría acelerar el diagnóstico de trastornos raros del desarrollo
- Analizador de pruebas sindrómicas actualizado permite acceso remoto a resultados de pruebas
- Prueba de PCR para infecciones respiratorias y de garganta detecta múltiples patógenos con síntomas coincidentes
- Técnica de enriquecimiento de ácido nucleico circulante en sangre permite diagnóstico no invasivo del cáncer de hígado
- Primera prueba molecular aprobada por la FDA para detectar malaria en donantes de sangre podría mejorar seguridad del paciente
- Prueba de biomarcadores líquidos detecta enfermedades neurodegenerativas antes de que aparezcan síntomas
- Nuevo método genómico ayuda a diagnosticar pacientes con enfermedad renal inexplicable
- Nuevo hidrogel inteligente allana el camino para nueva "piruleta" para diagnóstico de cáncer de boca
- Prueba de biomarcadores podría mejorar diagnóstico del cáncer de endometrio
- Prueba de ADN en heces de próxima generación supera a PIF en detección del cáncer colorrectal
- Innovador análisis de sangre de pTau217 es tan preciso como imágenes cerebrales o pruebas del LCR para diagnosticar Alzheimer
- Sistema de RT-PCR en el punto de atención de 10 minutos detecta hasta 32 objetivos por muestra