Prueba rápida detecta patógenos conocidos y desconocidos
Por el equipo editorial de LabMedica en español Actualizado el 26 Dec 2014 |
Imagen: Cargando una muestra de ADN viral con marca fluorescente en el Array de Detección Microbiana (Fotografía cortesía del Laboratorio Nacional Lawrence Livermore).
Una tecnología diagnóstica desarrollada para la detección rápida de los patógenos en las heridas de los soldados ha sido licenciada a una compañía privada que quiere usarla para crear pruebas de laboratorio nuevas.
El array de Detección Microbiana Lawrence Livermore (LLMDA) está diseñado para mejorar dos técnicas de identificación de patógenos: el análisis por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y la secuenciación del ADN. Las técnicas de diagnóstico de PCR pueden procesar hasta 50 firmas de ADN de una sola vez y la probabilidad de descubrir nuevas especies son bajas con una PCR. La nueva tecnología es capaz de identificar miles de bacterias y virus en un solo análisis.
Los científicos del Laboratorio Nacional Lawrence Livermore (LLNL, Livermore, CA, EUA) desarrollaron el LLMDA. El proceso se inicia purificando el ADN o ácido ribonucleico (ARN) de una muestra de sangre o de heces. El ADN o ARN purificado se marca con un colorante fluorescente, y luego se pipeta en el microarray que se encuentra en la parte superior de una incubadora calentada a 42°C. El microarray contiene cerca de 400.000 sondas dispuestas en un patrón de tablero de ajedrez sobre un portaobjetos de vidrio de 2,5 × 7,5 cm. Los científicos examinan estas sondas con un escáner fluorescente y un software de análisis de. El tablero de ajedrez, del microarray, tiene varias docenas de cuadros para cada uno de los miles de organismos secuenciados hasta la fecha. Eso permite examinar simultáneamente múltiples regiones para cada organismo.
A partir de un estudio que evaluó 124 muestras de heridas de 44 soldados heridos en Irak y Afganistán usando LLDMA, los científicos encontraron que ciertas bacterias, como las especies de Pseudomonas y de Acinetobacter baumannii, que son infecciones comunes relacionadas con el hospital, estaban asociados con heridas que no sanan con éxito. Las bacterias relacionadas, a menudo, con el sistema gastrointestinal, tales como Escherichia coli y las especies de Bacteroides, también se encuentran a menudo en las heridas que no se curan con éxito. La prueba fue capaz de detectar al cabo de 24 horas cualquier virus o una bacteria que haya sido secuenciado e incluido entre las sondas del array.
Los científicos del LLNL ya están desarrollando la capacidad de este array microbiano. Ellos están probando actualmente un LLMDA de última generación que contiene 2,1 millones de sondas que representan aproximadamente 178.000 secuencias de 5.700 virus y 785.000 secuencias de miles de bacterias. La nueva versión también incluye cerca de 237.000 secuencias de cientos de hongos y aproximadamente 202.000 secuencias de 75 protozoos. El Laboratorio Nacional Lawrence Livermore ha licenciado su tecnología de array de detección microbiana a MOgene LC (St. Louis, MO, EUA).
Enlaces relacionados:
Lawrence Livermore National Laboratory
MOgene LC
El array de Detección Microbiana Lawrence Livermore (LLMDA) está diseñado para mejorar dos técnicas de identificación de patógenos: el análisis por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y la secuenciación del ADN. Las técnicas de diagnóstico de PCR pueden procesar hasta 50 firmas de ADN de una sola vez y la probabilidad de descubrir nuevas especies son bajas con una PCR. La nueva tecnología es capaz de identificar miles de bacterias y virus en un solo análisis.
Los científicos del Laboratorio Nacional Lawrence Livermore (LLNL, Livermore, CA, EUA) desarrollaron el LLMDA. El proceso se inicia purificando el ADN o ácido ribonucleico (ARN) de una muestra de sangre o de heces. El ADN o ARN purificado se marca con un colorante fluorescente, y luego se pipeta en el microarray que se encuentra en la parte superior de una incubadora calentada a 42°C. El microarray contiene cerca de 400.000 sondas dispuestas en un patrón de tablero de ajedrez sobre un portaobjetos de vidrio de 2,5 × 7,5 cm. Los científicos examinan estas sondas con un escáner fluorescente y un software de análisis de. El tablero de ajedrez, del microarray, tiene varias docenas de cuadros para cada uno de los miles de organismos secuenciados hasta la fecha. Eso permite examinar simultáneamente múltiples regiones para cada organismo.
A partir de un estudio que evaluó 124 muestras de heridas de 44 soldados heridos en Irak y Afganistán usando LLDMA, los científicos encontraron que ciertas bacterias, como las especies de Pseudomonas y de Acinetobacter baumannii, que son infecciones comunes relacionadas con el hospital, estaban asociados con heridas que no sanan con éxito. Las bacterias relacionadas, a menudo, con el sistema gastrointestinal, tales como Escherichia coli y las especies de Bacteroides, también se encuentran a menudo en las heridas que no se curan con éxito. La prueba fue capaz de detectar al cabo de 24 horas cualquier virus o una bacteria que haya sido secuenciado e incluido entre las sondas del array.
Los científicos del LLNL ya están desarrollando la capacidad de este array microbiano. Ellos están probando actualmente un LLMDA de última generación que contiene 2,1 millones de sondas que representan aproximadamente 178.000 secuencias de 5.700 virus y 785.000 secuencias de miles de bacterias. La nueva versión también incluye cerca de 237.000 secuencias de cientos de hongos y aproximadamente 202.000 secuencias de 75 protozoos. El Laboratorio Nacional Lawrence Livermore ha licenciado su tecnología de array de detección microbiana a MOgene LC (St. Louis, MO, EUA).
Enlaces relacionados:
Lawrence Livermore National Laboratory
MOgene LC
Últimas Microbiología noticias
- Nuevos ensayos de hepatitis con marcado CE permite la detección temprana de infecciones
- Prueba de PCR múltiplex identifica el 95 % de los patógenos que causan la sepsis en una hora
- Prueba de bacterias bucales podría predecir la progresión del cáncer de colon
- Firma metabólica unica podría permitir el diagnóstico de sepsis dentro de una hora de la extracción de sangre
- Innovadora plataforma de diagnóstico proporciona resultados de AST con velocidad sin precedentes
- Análisis de sangre predice sepsis e insuficiencia orgánica en niños
- Análisis de sangre para tuberculosis podría detectar millones de propagadores silenciosos
- Un análisis de sangre simple combinado con un modelo de riesgo personalizado mejora el diagnóstico de sepsis
- Nuevo análisis de sangre reduce tiempo de diagnóstico de infecciones por micobacterias no tuberculosas de meses a horas
- Nuevo análisis para tuberculosis podría ampliar acceso a pruebas en países de ingresos bajos y medios
- Prueba rápida diagnostica enfermedades tropicales en horas para tratamiento con antibióticos más rápido
- Pruebas moleculares rápidas permiten tratamiento antibiótico más rápido y específico para neumonía
- Plataforma rápida de PSA proporciona resultados terapéuticos específicos días antes que el estándar de atención actual
- Nuevo método de análisis detecta patógenos en sangre de forma más rápida y precisa al fundir ADN
- Prueba rápida de sepsis ofrece resultados dos días más rápidos
- Diagnóstico rápido portátil por PCR podría detectar gonorrea y susceptibilidad a antibióticos