Expresión de ARN del huésped diagnostica la tuberculosis infantil
Por el equipo editorial de LabMedica en español Actualizado el 29 May 2014 |
Imagen: Los kits de ARN en sangre PAXgene (Fotografía cortesía de Qiagen).
La tuberculosis (TB) es notoriamente difícil de diagnosticar en niños y cuando se diagnostica, la enfermedad se encuentra en sus últimas etapas y ya se ha diseminado al cerebro y otros órganos, aumentando el riesgo de muerte.
Se ha explorado el uso de la expresión de ácido ribonucleico (ARN), de todo el genoma, en la sangre del huésped, para diferenciar la tuberculosis de otras enfermedades que son prevalentes entre los niños africanos con y sin infección por el virus de inmunodeficiencia humana (VIH).
Un equipo internacional de científicos liderado por aquellos en el Colegio Imperial de Londres (Reino Unido) analizó a más de 2.800 niños de Malawi, Kenia y Sudáfrica. Todos los niños habían sido ingresados en el hospital con síntomas de tuberculosis. Luego establecieron que los niños tenían una tuberculosis comprobada y que los niños habían sido limpiados de la enfermedad. Los pacientes fueron reclutados entre el 17 de febrero de 2008 y el 27 de enero de 2011.
Se examinaron dos muestras de esputo espontáneo o inducido y una muestra de tejido o líquido cefalorraquídeo (si estaba indicado clínicamente) en busca de bacilos ácido-alcohol resistentes y las muestras fueron cultivadas para micobacterias. El análisis de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real(PCR), Xpert MTB/RIF21 (Cepheid; Sunnyvale, CA, EUA), que es una prueba para Mycobacterium tuberculosis y para la resistencia a la rifampicina, fue realizado en muestras respiratorias en la cohorte de Kenia. Se recolectó sangre total extraída con el uso de los kits PAXgene ARN en Sangre (Qiagen, Venlo, Holanda) la cual fue analizada en los arrays BeadChip de Expresión HumanHT-12 v.4 (Illumina; San Diego, CA, EUA).
El equipo identificó una firma de transcriptoma específica para la tuberculosis en la sangre del huésped que parece ser valiosa para diferenciar la tuberculosis de otras enfermedades con características clínicas similares, en niños africanos infectados y no infectados con el VIH. La puntuación de riesgo identificó una mayor proporción de casos confirmados mediante cultivo de la tuberculosis y de los casos con cultivos negativos según el análisis Xpert MTB/RIF. La puntuación de riesgo también fue más sensible que el análisis de liberación de interferón γ (IGRA) y el nivel de proteína C-reactiva resultó ser un marcador biológico muy malo para la tuberculosis infantil. Mediante el estudio de 51 genes específicos en la sangre de los niños con tuberculosis, la enfermedad puede ser identificada en el 80% de los casos.
Los autores llegaron a la conclusión de que la traducción de las firmas de transcripción en herramientas de diagnóstico en las comunidades de escasos recursos, será un reto y será necesaria la innovación para reducir el costo y la complejidad de los métodos actuales utilizados para detectar múltiples transcripciones del ARN. El desarrollo de una prueba basada en la escala de riesgo para la tuberculosis podría mejorar el diagnóstico y la vigilancia de la tuberculosis infantil en zonas con una carga alta o baja de la enfermedad. El estudio fue publicado el 1 de mayo de 2014, en la revista New England Journal of Medicine.
Enlaces relacionados:
Imperial College London
Cepheid
Qiagen
Illumina
Se ha explorado el uso de la expresión de ácido ribonucleico (ARN), de todo el genoma, en la sangre del huésped, para diferenciar la tuberculosis de otras enfermedades que son prevalentes entre los niños africanos con y sin infección por el virus de inmunodeficiencia humana (VIH).
Un equipo internacional de científicos liderado por aquellos en el Colegio Imperial de Londres (Reino Unido) analizó a más de 2.800 niños de Malawi, Kenia y Sudáfrica. Todos los niños habían sido ingresados en el hospital con síntomas de tuberculosis. Luego establecieron que los niños tenían una tuberculosis comprobada y que los niños habían sido limpiados de la enfermedad. Los pacientes fueron reclutados entre el 17 de febrero de 2008 y el 27 de enero de 2011.
Se examinaron dos muestras de esputo espontáneo o inducido y una muestra de tejido o líquido cefalorraquídeo (si estaba indicado clínicamente) en busca de bacilos ácido-alcohol resistentes y las muestras fueron cultivadas para micobacterias. El análisis de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real(PCR), Xpert MTB/RIF21 (Cepheid; Sunnyvale, CA, EUA), que es una prueba para Mycobacterium tuberculosis y para la resistencia a la rifampicina, fue realizado en muestras respiratorias en la cohorte de Kenia. Se recolectó sangre total extraída con el uso de los kits PAXgene ARN en Sangre (Qiagen, Venlo, Holanda) la cual fue analizada en los arrays BeadChip de Expresión HumanHT-12 v.4 (Illumina; San Diego, CA, EUA).
El equipo identificó una firma de transcriptoma específica para la tuberculosis en la sangre del huésped que parece ser valiosa para diferenciar la tuberculosis de otras enfermedades con características clínicas similares, en niños africanos infectados y no infectados con el VIH. La puntuación de riesgo identificó una mayor proporción de casos confirmados mediante cultivo de la tuberculosis y de los casos con cultivos negativos según el análisis Xpert MTB/RIF. La puntuación de riesgo también fue más sensible que el análisis de liberación de interferón γ (IGRA) y el nivel de proteína C-reactiva resultó ser un marcador biológico muy malo para la tuberculosis infantil. Mediante el estudio de 51 genes específicos en la sangre de los niños con tuberculosis, la enfermedad puede ser identificada en el 80% de los casos.
Los autores llegaron a la conclusión de que la traducción de las firmas de transcripción en herramientas de diagnóstico en las comunidades de escasos recursos, será un reto y será necesaria la innovación para reducir el costo y la complejidad de los métodos actuales utilizados para detectar múltiples transcripciones del ARN. El desarrollo de una prueba basada en la escala de riesgo para la tuberculosis podría mejorar el diagnóstico y la vigilancia de la tuberculosis infantil en zonas con una carga alta o baja de la enfermedad. El estudio fue publicado el 1 de mayo de 2014, en la revista New England Journal of Medicine.
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