Completan estudio genómico del cáncer de cuello uterino
Por el equipo editorial de LabMedica en español Actualizado el 11 Feb 2014 |
Imagen: El analizador genómico Illumina (Fotografía cortesía de Illumina).
Se ha completado un análisis genómico integral del cáncer de cuello uterino en dos poblaciones de pacientes y se han identificado mutaciones genéticas recurrentes que no se habían encontrado previamente en el cáncer de cuello uterino.
El cáncer de cuello uterino es el segundo cáncer más común en las mujeres y es responsable de aproximadamente el 10% de las muertes por cáncer en las mujeres, en particular en los países en desarrollo, donde los métodos de detección no son fácilmente accesibles y casi todos los casos de la enfermedad son causados por la exposición al virus del papiloma humano (VPH).
Un equipo internacional de científicos y dirigido por los del Instituto Broad (Cambridge, MA, EUA) realizaron la secuenciación de todo el exoma, que examina el código genético en las regiones codificantes de proteínas del genoma, en muestras de 115 pacientes con cáncer de cuello uterino de Noruega y México. El ADN genómico y el ácido ribonucleico (ARN) fueron extraídos de tumores en que se había encontrado, por la investigación de cortes congelados, que tenían un componente de células epiteliales malignas superior al 40%.
El ADN de 115 muestras apareadas de tumor normal fue sometido a la selección de híbridos basada en Sure-Select Human All Exon v2.0 (Agilent, Santa Clara, CA, EUA), seguido por la construcción de biblioteca de exomas para la secuenciación (Illumina; San Diego, CA, EUA) y 14 pares para la construcción de la biblioteca del genoma entero. El ADN complementario (ADNc), a partir de 79 muestras, fue sometido a la construcción de la biblioteca de transcriptomas, de acuerdo con métodos estándar.
El estudio identificó 13 mutaciones que ocurrieron con suficiente frecuencia a través de las muestras para ser consideradas significativas en el cáncer de cuello uterino. Ocho de estas mutaciones no habían sido relacionados anteriormente con la enfermedad, y dos no había sido vistas, con anterioridad, en ningún tipo de cáncer. Entre los hallazgos más notables se encontraban las mutaciones puntuales somáticas en el gen Homólogo Viral de la Leucemia Eritroblástica Aviar V-Erb-B2 (ERBB2), que fue encontrado en un subgrupo pequeño pero significativo de los tumores. Las mutaciones en este gen no habían sido relacionadas previamente con el cáncer de cuello uterino, pero es un oncogén conocido común en el cáncer de mama. El equipo también identificó una nueva mutación en el gen de la proteína quinasa 1 activada por mitógeno (MAPK1) y otro hallazgo clave fue la prevalencia de mutaciones en genes que afectan el sistema inmune.
Hugo Alberto Barrera Saldaña, PhD, un profesor de bioquímica y coautor del estudio, dijo: “Los resultados destacados de nuestra investigación internacional colaborativa exitosa nos está dando, aquí en México, argumentos muy poderosos a favor de los beneficios de la aceleración de la adopción de métodos moleculares para la detección del VPH, seguida por la colposcopia para detectar el cáncer en sus fases más tempranas, cuando es curable, por no mencionar la posibilidad de nuevas terapias dirigidas que nuestros descubrimientos abren”. El estudio fue publicado el 25 de diciembre 2103, en la revista Nature.
Enlaces relacionados:
Broad Institute
Agilent
Illumina
El cáncer de cuello uterino es el segundo cáncer más común en las mujeres y es responsable de aproximadamente el 10% de las muertes por cáncer en las mujeres, en particular en los países en desarrollo, donde los métodos de detección no son fácilmente accesibles y casi todos los casos de la enfermedad son causados por la exposición al virus del papiloma humano (VPH).
Un equipo internacional de científicos y dirigido por los del Instituto Broad (Cambridge, MA, EUA) realizaron la secuenciación de todo el exoma, que examina el código genético en las regiones codificantes de proteínas del genoma, en muestras de 115 pacientes con cáncer de cuello uterino de Noruega y México. El ADN genómico y el ácido ribonucleico (ARN) fueron extraídos de tumores en que se había encontrado, por la investigación de cortes congelados, que tenían un componente de células epiteliales malignas superior al 40%.
El ADN de 115 muestras apareadas de tumor normal fue sometido a la selección de híbridos basada en Sure-Select Human All Exon v2.0 (Agilent, Santa Clara, CA, EUA), seguido por la construcción de biblioteca de exomas para la secuenciación (Illumina; San Diego, CA, EUA) y 14 pares para la construcción de la biblioteca del genoma entero. El ADN complementario (ADNc), a partir de 79 muestras, fue sometido a la construcción de la biblioteca de transcriptomas, de acuerdo con métodos estándar.
El estudio identificó 13 mutaciones que ocurrieron con suficiente frecuencia a través de las muestras para ser consideradas significativas en el cáncer de cuello uterino. Ocho de estas mutaciones no habían sido relacionados anteriormente con la enfermedad, y dos no había sido vistas, con anterioridad, en ningún tipo de cáncer. Entre los hallazgos más notables se encontraban las mutaciones puntuales somáticas en el gen Homólogo Viral de la Leucemia Eritroblástica Aviar V-Erb-B2 (ERBB2), que fue encontrado en un subgrupo pequeño pero significativo de los tumores. Las mutaciones en este gen no habían sido relacionadas previamente con el cáncer de cuello uterino, pero es un oncogén conocido común en el cáncer de mama. El equipo también identificó una nueva mutación en el gen de la proteína quinasa 1 activada por mitógeno (MAPK1) y otro hallazgo clave fue la prevalencia de mutaciones en genes que afectan el sistema inmune.
Hugo Alberto Barrera Saldaña, PhD, un profesor de bioquímica y coautor del estudio, dijo: “Los resultados destacados de nuestra investigación internacional colaborativa exitosa nos está dando, aquí en México, argumentos muy poderosos a favor de los beneficios de la aceleración de la adopción de métodos moleculares para la detección del VPH, seguida por la colposcopia para detectar el cáncer en sus fases más tempranas, cuando es curable, por no mencionar la posibilidad de nuevas terapias dirigidas que nuestros descubrimientos abren”. El estudio fue publicado el 25 de diciembre 2103, en la revista Nature.
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