Prueba nueva masiva para el coronavirus es 100 veces más sensible que las pruebas rápidas de antígeno
Por el equipo editorial de LabMedica en español Actualizado el 06 Jul 2021 |

Imagen: El material del frotis teñido de azul de las pruebas coronavirus se prepara para análisis en un dispositivo de secuenciación con la ayuda de un robot de laboratorio (Fotografía cortesía de Felix Heyder/ Hospital Universitario de Bonn)
Una prueba nueva para coronavirus, desarrollada en el Hospital Universitario de Bonn, puede analizar una gran cantidad de hisopos simultáneamente utilizando tecnología de secuenciación y tiene una sensibilidad similarmente alta a la prueba común de qPCR.
La prueba novedosa para el coronavirus “LAMP-Seq”, desarrollada en el Hospital Universitario de Bonn (Bonn, Alemania), ofrece la posibilidad de analizar a muchas personas con regularidad para detectar el virus SARS-CoV-2. Ofrece un gran potencial, especialmente para pruebas sistemáticas en guarderías, escuelas o empresas. De esta manera, las infecciones se pueden detectar en una etapa temprana y las cadenas de infección correspondientes se pueden interrumpir rápidamente. El método LAMP-Seq detecta no solo las infecciones con el virus SARS-CoV-2 original, sino también las nuevas variantes de interés alfa a delta.
Para la prueba “LAMP-Seq”, los científicos de Bonn han adaptado el método LAMP ya establecido (“amplificación isotérmica mediada por bucle” - propagación del genoma viral a temperatura constante) y lo han hecho compatible con las máquinas de secuenciación utilizadas para la investigación biomédica. Como resultado, se pueden analizar muchas muestras simultáneamente en un procedimiento de alto rendimiento. Antes de que miles de muestras se analicen juntas en un análisis de secuenciación, cada muestra individual se vincula a un código de barras molecular. Este código de barras garantiza que se pueda asignar cada muestra sin duda alguna, incluso después de que se hayan mezclado miles de muestras. Esta tecnología reduce significativamente el costo por prueba en comparación con la prueba qPCR y hace que el procedimiento “LAMP-Seq” sea una prueba masiva escalable para el coronavirus.
Incluso los modelos más pequeños de las máquinas secuenciadoras utilizadas son capaces de analizar alrededor de 10.000 muestras en un solo procesamiento (duración: alrededor de 10 a 12 horas). Esto prácticamente elimina la capacidad del laboratorio como factor limitante en las pruebas. En varios estudios grandes (incluidas las pruebas realizadas en escuelas y empleados) con un total de alrededor de 20.000 pruebas, los científicos de Bonn han probado, optimizado y validado con éxito toda la logística anterior y posterior, desde la recolección de muestras mediante frotis de garganta hasta la retroalimentación totalmente digital de los resultados de la prueba.
Si bien los científicos de Bonn han centrado su método innovador por completo en las pruebas para el SARS-CoV-2, “LAMP-Seq” también se puede utilizar en el futuro para el diagnóstico diferencial en las pruebas de otros virus como la influenza A y también se puede adaptar rápidamente a otros virus. Los científicos trabajan actualmente en la certificación CE para que la prueba “LAMP-Seq” esté disponible internacionalmente en un futuro próximo. Hasta que se obtenga esta aprobación, el método “LAMP-Seq” validado técnica y científicamente se seguirá utilizando para las pruebas piloto.
“Nuestra prueba para el coronavirus LAMP-Seq puede detectar cantidades de virus aproximadamente 100 veces menores que las pruebas rápidas de antígenos actuales y es casi tan sensible y específica como la prueba común de qPCR”, dijo el Prof. Dr. Jonathan Schmid-Burgk del Instituto de Química Clínica y Farmacología clínica de la UKB. “A esto se suma la alta escalabilidad de la prueba. Mediante el uso de máquinas de secuenciación, se pueden analizar miles de muestras simultáneamente”.
“Por lo tanto, ya no es necesario volver a realizar la prueba de todo el grupo en caso de un resultado positivo”, dijo la Dra. Kerstin Ludwig, líder del grupo Emmy-Noether en el Instituto de Genética Humana. “Con su alto rendimiento y sensibilidad, la prueba ‘LAMP-Seq’ puede hacer una contribución significativa a la detección de infecciones no detectadas. Especialmente en escuelas o empresas, donde muchas personas se reúnen regularmente, la prueba para el coronavirus es ideal para monitorear sistemática y preventivamente la aparición de infecciones”.
Enlace relacionado:
Hospital Universitario de Bonn
La prueba novedosa para el coronavirus “LAMP-Seq”, desarrollada en el Hospital Universitario de Bonn (Bonn, Alemania), ofrece la posibilidad de analizar a muchas personas con regularidad para detectar el virus SARS-CoV-2. Ofrece un gran potencial, especialmente para pruebas sistemáticas en guarderías, escuelas o empresas. De esta manera, las infecciones se pueden detectar en una etapa temprana y las cadenas de infección correspondientes se pueden interrumpir rápidamente. El método LAMP-Seq detecta no solo las infecciones con el virus SARS-CoV-2 original, sino también las nuevas variantes de interés alfa a delta.
Para la prueba “LAMP-Seq”, los científicos de Bonn han adaptado el método LAMP ya establecido (“amplificación isotérmica mediada por bucle” - propagación del genoma viral a temperatura constante) y lo han hecho compatible con las máquinas de secuenciación utilizadas para la investigación biomédica. Como resultado, se pueden analizar muchas muestras simultáneamente en un procedimiento de alto rendimiento. Antes de que miles de muestras se analicen juntas en un análisis de secuenciación, cada muestra individual se vincula a un código de barras molecular. Este código de barras garantiza que se pueda asignar cada muestra sin duda alguna, incluso después de que se hayan mezclado miles de muestras. Esta tecnología reduce significativamente el costo por prueba en comparación con la prueba qPCR y hace que el procedimiento “LAMP-Seq” sea una prueba masiva escalable para el coronavirus.
Incluso los modelos más pequeños de las máquinas secuenciadoras utilizadas son capaces de analizar alrededor de 10.000 muestras en un solo procesamiento (duración: alrededor de 10 a 12 horas). Esto prácticamente elimina la capacidad del laboratorio como factor limitante en las pruebas. En varios estudios grandes (incluidas las pruebas realizadas en escuelas y empleados) con un total de alrededor de 20.000 pruebas, los científicos de Bonn han probado, optimizado y validado con éxito toda la logística anterior y posterior, desde la recolección de muestras mediante frotis de garganta hasta la retroalimentación totalmente digital de los resultados de la prueba.
Si bien los científicos de Bonn han centrado su método innovador por completo en las pruebas para el SARS-CoV-2, “LAMP-Seq” también se puede utilizar en el futuro para el diagnóstico diferencial en las pruebas de otros virus como la influenza A y también se puede adaptar rápidamente a otros virus. Los científicos trabajan actualmente en la certificación CE para que la prueba “LAMP-Seq” esté disponible internacionalmente en un futuro próximo. Hasta que se obtenga esta aprobación, el método “LAMP-Seq” validado técnica y científicamente se seguirá utilizando para las pruebas piloto.
“Nuestra prueba para el coronavirus LAMP-Seq puede detectar cantidades de virus aproximadamente 100 veces menores que las pruebas rápidas de antígenos actuales y es casi tan sensible y específica como la prueba común de qPCR”, dijo el Prof. Dr. Jonathan Schmid-Burgk del Instituto de Química Clínica y Farmacología clínica de la UKB. “A esto se suma la alta escalabilidad de la prueba. Mediante el uso de máquinas de secuenciación, se pueden analizar miles de muestras simultáneamente”.
“Por lo tanto, ya no es necesario volver a realizar la prueba de todo el grupo en caso de un resultado positivo”, dijo la Dra. Kerstin Ludwig, líder del grupo Emmy-Noether en el Instituto de Genética Humana. “Con su alto rendimiento y sensibilidad, la prueba ‘LAMP-Seq’ puede hacer una contribución significativa a la detección de infecciones no detectadas. Especialmente en escuelas o empresas, donde muchas personas se reúnen regularmente, la prueba para el coronavirus es ideal para monitorear sistemática y preventivamente la aparición de infecciones”.
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