La realización de pruebas con un panel de varios genes detecta variantes de riesgo de cáncer
Por el equipo editorial de LabMedica en español Actualizado el 01 May 2019 |
Imagen: Un kit de recolección de muestras para el panel completo expandido Multi-Cáncer de 83-genes que aumenta el rendimiento de los diagnósticos (Fotografía cortesía de Invitae).
Cada año se diagnostican más de 608.000 pacientes con cáncer de ovario, mama, páncreas, próstata y colorrectal. Las pautas actuales recomiendan examinar a todos los pacientes con cáncer de ovario y páncreas, así como a los pacientes con cáncer de próstata, mama y colorrectal (CRC) que cumplan con ciertos criterios.
Sin embargo, tales directrices dicen poco sobre el papel de las pruebas de panel de múltiples genes expandidos en estos pacientes. Los estudios han comenzado a demostrar que las pruebas de la línea germinal que utilizan paneles integrales de múltiples genes identifican mutaciones clínicamente accionables en genes distintos a los recomendados por el tipo de cáncer del paciente, a un costo incremental muy modesto para descubrir estas mutaciones adicionales.
Un equipo de científicos que colaboran con la compañía de pruebas genéticas Invitae (San Francisco, CA, EUA) analizaron datos de secuencias no identificadas para 83 genes de riesgo de cáncer en pacientes con 81.861 cánceres de seno, 11.124 de ovario, 9.669 CRC, 5.794 de próstata, y 4.659 con cáncer pancreático, referidos para pruebas genéticas de cáncer hereditario. Estos genes se evaluaron de manera uniforme para todos los pacientes en este estudio, independientemente de los genes específicos ordenados por los clínicos en base a la historia personal/familiar.
El equipo comparó la tasa positiva para cada tipo de cáncer, donde un informe positivo se definió por la presencia de una variante probablemente patógena (LP) o patógena (P). Las tasas positivas para un panel genético mínimo para la indicación respectiva (por ejemplo, BRCA1/2 o los cinco genes del Síndrome de Lynch [LS]) se calcularon y compararon con las tasas positivas cuando se analizó el panel completo de 83 genes.
Cuando se aplicó el panel completo Invitae Multi-Cáncer de 83-genes, el desempeño diagnóstico general de los 113.107 pacientes con cánceres de mama, ovario, páncreas, próstata y CCR aumentó casi 4 veces hasta el 16%. La exclusión de las variantes monoalélicas P/LP en los genes de riesgo de cáncer predominantemente recesivos (por ejemplo, MUTYH) reduce el desempeño diagnóstico al 13%. Estratificado por tipo de cáncer y eliminando los recesivos monoalélicos, el desempeño positivo fue: mama 11,8%, ovario 18%, próstata 15%, pancreático 16% y CCR 19%.
Los autores concluyeron que su estudio sugiere que se deberían ampliar las pautas de pruebas genéticas para incluir recomendaciones claras que respalden las pruebas con paneles de múltiples genes en pacientes con cáncer, con el fin de mejorar la atención de los pacientes y sus familiares. Robert Nussbaum, MD, director médico de Invitae, dijo: “Los paneles de pruebas genéticas que incluyen solo algunos de los genes clínicamente importantes proporcionan información genética incompleta para los pacientes y sus médicos, tanto para informar las opciones de tratamiento como para identificar de riesgos de salud adicionales”. El estudio se presentó en el congreso anual del Colegio Americano de Genética Médica y Genómica, que se realizó del 2 al 6 de abril de 2019 en Seattle, WA, EUA.
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Invitae
Sin embargo, tales directrices dicen poco sobre el papel de las pruebas de panel de múltiples genes expandidos en estos pacientes. Los estudios han comenzado a demostrar que las pruebas de la línea germinal que utilizan paneles integrales de múltiples genes identifican mutaciones clínicamente accionables en genes distintos a los recomendados por el tipo de cáncer del paciente, a un costo incremental muy modesto para descubrir estas mutaciones adicionales.
Un equipo de científicos que colaboran con la compañía de pruebas genéticas Invitae (San Francisco, CA, EUA) analizaron datos de secuencias no identificadas para 83 genes de riesgo de cáncer en pacientes con 81.861 cánceres de seno, 11.124 de ovario, 9.669 CRC, 5.794 de próstata, y 4.659 con cáncer pancreático, referidos para pruebas genéticas de cáncer hereditario. Estos genes se evaluaron de manera uniforme para todos los pacientes en este estudio, independientemente de los genes específicos ordenados por los clínicos en base a la historia personal/familiar.
El equipo comparó la tasa positiva para cada tipo de cáncer, donde un informe positivo se definió por la presencia de una variante probablemente patógena (LP) o patógena (P). Las tasas positivas para un panel genético mínimo para la indicación respectiva (por ejemplo, BRCA1/2 o los cinco genes del Síndrome de Lynch [LS]) se calcularon y compararon con las tasas positivas cuando se analizó el panel completo de 83 genes.
Cuando se aplicó el panel completo Invitae Multi-Cáncer de 83-genes, el desempeño diagnóstico general de los 113.107 pacientes con cánceres de mama, ovario, páncreas, próstata y CCR aumentó casi 4 veces hasta el 16%. La exclusión de las variantes monoalélicas P/LP en los genes de riesgo de cáncer predominantemente recesivos (por ejemplo, MUTYH) reduce el desempeño diagnóstico al 13%. Estratificado por tipo de cáncer y eliminando los recesivos monoalélicos, el desempeño positivo fue: mama 11,8%, ovario 18%, próstata 15%, pancreático 16% y CCR 19%.
Los autores concluyeron que su estudio sugiere que se deberían ampliar las pautas de pruebas genéticas para incluir recomendaciones claras que respalden las pruebas con paneles de múltiples genes en pacientes con cáncer, con el fin de mejorar la atención de los pacientes y sus familiares. Robert Nussbaum, MD, director médico de Invitae, dijo: “Los paneles de pruebas genéticas que incluyen solo algunos de los genes clínicamente importantes proporcionan información genética incompleta para los pacientes y sus médicos, tanto para informar las opciones de tratamiento como para identificar de riesgos de salud adicionales”. El estudio se presentó en el congreso anual del Colegio Americano de Genética Médica y Genómica, que se realizó del 2 al 6 de abril de 2019 en Seattle, WA, EUA.
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