Se identifican SNP para el riesgo de hemorragia en afroamericanos que toman warfarina
Por el equipo editorial de LabMedica en español Actualizado el 13 Nov 2018 |
Imagen: El Kit Human610-Quad BeadChip utiliza el Super Ensayo de Infinium HD y es compatible con los sistemas Lectores iScan, HiScan y Bead Array (Fotografía cortesía de Illumina).
La hemorragia mayor relacionada con warfarina ocurre con más frecuencia en los afroamericanos que en otras poblaciones. La identificación de posibles factores genéticos relacionados con este evento adverso puede ayudar a identificar a los pacientes en riesgo.
La warfarina es un anticoagulante que se usa para prevenir ataques cardíacos, derrames cerebrales y coágulos de sangre. Se han identificado un puñado de nuevas variantes que parecen predisponer a los individuos de ascendencia africana a un mayor riesgo de hemorragia cuando toman la warfarina como anticoagulante.
Los científicos de la Universidad Northwestern (Chicago, IL, EUA) y sus colegas, realizaron un estudio de asociación de genoma en el que participaron 31 personas que experimentaron sangrado relacionado con la warfarina y 184 individuos de control que fueron tratados con warfarina pero que no experimentaron problemas posteriores de hemorragia. El equipo realizó la genotipificación de casi 8,2 millones de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) utilizando el Illumina 610 Quad BeadChip (Illumina, San Diego, CA, EUA). El sangrado mayor se definió como un sangrado que requirió hospitalización, que causó una disminución en el nivel de hemoglobina de más de 2 g/dL, que requirió una transfusión de sangre, o cualquier combinación de los 3, mientras se tomaba warfarina a un índice internacional normalizado INR de menos de 4.
El equipo encontró cuatro SNP sospechosos en desequilibrio de asociación en el cromosoma 6. Luego de un análisis de replicación en otros 40 casos y 148 controles sin hemorragia tratados con warfarina, una de las variantes rs78132896 en el promotor del gen de la subfamilia de la proteína EPHA7 de la efrina mostró vínculos significativos en todo el genoma con el riesgo de sangrado en los afroamericanos evaluados, en base a un ensayo de coagulación conocido como el índice internacional normalizado (INR). Los siguientes ensayos de expresión in vitro del equipo indicaron que el SNP rs78132896, en el promotor EPHA7, y una variante en el desequilibrio de asociación en el potenciador del gen, parecían corresponder a una expresión más pronunciada de EPHA7. El SNP rs78132896 ocurrió en 11 casos (35,5%) y nueve controles (4,9%) en la cohorte de descubrimiento, y la asociación se confirmó en la cohorte de replicación, el SNP estuvo presente en 14 casos (35,0%) y siete controles (4,8%).
Minoli A. Perera, PharmD, PhD, profesora asociada y autora principal del estudio, dijo: “En este estudio preliminar con pacientes de ascendencia africana que tomaban warfarina, se asociaron cuatro polimorfismos de un solo nucleótido en desequilibrio de enlace en el cromosoma 6, con un aumento en el riesgo de hemorragia grave para valores de INR de menos de cuatro”. El estudio se publicó el 23 de octubre de 2018 en la revista Journal of the American Medical Association.
Enlace relacionado:
Universidad Northwestern
Illumina
La warfarina es un anticoagulante que se usa para prevenir ataques cardíacos, derrames cerebrales y coágulos de sangre. Se han identificado un puñado de nuevas variantes que parecen predisponer a los individuos de ascendencia africana a un mayor riesgo de hemorragia cuando toman la warfarina como anticoagulante.
Los científicos de la Universidad Northwestern (Chicago, IL, EUA) y sus colegas, realizaron un estudio de asociación de genoma en el que participaron 31 personas que experimentaron sangrado relacionado con la warfarina y 184 individuos de control que fueron tratados con warfarina pero que no experimentaron problemas posteriores de hemorragia. El equipo realizó la genotipificación de casi 8,2 millones de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) utilizando el Illumina 610 Quad BeadChip (Illumina, San Diego, CA, EUA). El sangrado mayor se definió como un sangrado que requirió hospitalización, que causó una disminución en el nivel de hemoglobina de más de 2 g/dL, que requirió una transfusión de sangre, o cualquier combinación de los 3, mientras se tomaba warfarina a un índice internacional normalizado INR de menos de 4.
El equipo encontró cuatro SNP sospechosos en desequilibrio de asociación en el cromosoma 6. Luego de un análisis de replicación en otros 40 casos y 148 controles sin hemorragia tratados con warfarina, una de las variantes rs78132896 en el promotor del gen de la subfamilia de la proteína EPHA7 de la efrina mostró vínculos significativos en todo el genoma con el riesgo de sangrado en los afroamericanos evaluados, en base a un ensayo de coagulación conocido como el índice internacional normalizado (INR). Los siguientes ensayos de expresión in vitro del equipo indicaron que el SNP rs78132896, en el promotor EPHA7, y una variante en el desequilibrio de asociación en el potenciador del gen, parecían corresponder a una expresión más pronunciada de EPHA7. El SNP rs78132896 ocurrió en 11 casos (35,5%) y nueve controles (4,9%) en la cohorte de descubrimiento, y la asociación se confirmó en la cohorte de replicación, el SNP estuvo presente en 14 casos (35,0%) y siete controles (4,8%).
Minoli A. Perera, PharmD, PhD, profesora asociada y autora principal del estudio, dijo: “En este estudio preliminar con pacientes de ascendencia africana que tomaban warfarina, se asociaron cuatro polimorfismos de un solo nucleótido en desequilibrio de enlace en el cromosoma 6, con un aumento en el riesgo de hemorragia grave para valores de INR de menos de cuatro”. El estudio se publicó el 23 de octubre de 2018 en la revista Journal of the American Medical Association.
Enlace relacionado:
Universidad Northwestern
Illumina
Últimas Diagnóstico Molecular noticias
- Enfoque revolucionario de análisis de células T permite detección temprana del cáncer
- Prueba genética única podría acelerar el diagnóstico de trastornos raros del desarrollo
- Analizador de pruebas sindrómicas actualizado permite acceso remoto a resultados de pruebas
- Prueba de PCR para infecciones respiratorias y de garganta detecta múltiples patógenos con síntomas coincidentes
- Técnica de enriquecimiento de ácido nucleico circulante en sangre permite diagnóstico no invasivo del cáncer de hígado
- Primera prueba molecular aprobada por la FDA para detectar malaria en donantes de sangre podría mejorar seguridad del paciente
- Prueba de biomarcadores líquidos detecta enfermedades neurodegenerativas antes de que aparezcan síntomas
- Nuevo método genómico ayuda a diagnosticar pacientes con enfermedad renal inexplicable
- Nuevo hidrogel inteligente allana el camino para nueva "piruleta" para diagnóstico de cáncer de boca
- Prueba de biomarcadores podría mejorar diagnóstico del cáncer de endometrio
- Prueba de ADN en heces de próxima generación supera a PIF en detección del cáncer colorrectal
- Innovador análisis de sangre de pTau217 es tan preciso como imágenes cerebrales o pruebas del LCR para diagnosticar Alzheimer
- Sistema de RT-PCR en el punto de atención de 10 minutos detecta hasta 32 objetivos por muestra
- Células extraídas de orina podrían permitir detección más temprana de enfermedad renal
- Análisis de sangre identifica a personas con mayor riesgo de morir por insuficiencia cardíaca
- Análisis de sangre muestra precisión del 83 % para detectar cáncer colorrectal