NIPT de todo el genoma descubren hallazgos adicionales

La creciente conciencia sobre las pruebas fetales, junto con los avances tecnológicos, ha impulsado la demanda clínica de pruebas prenatales no invasivas (NIPT por sus siglas en inglés), lo que convierte a esta prueba en un componente importante de la atención prenatal en todo el mundo.

Los proveedores de NIPT están ampliando la prueba más allá de la detección de las aneuploidías comunes: (trisomía 21 (síndrome de Down), 18 (síndrome de Edwards) y 13 (síndrome de Patau) a la detección de todo el genoma. Las pruebas prenatales también se han adaptado y ampliado para detectar aneuploidías cromosómicas que incluyen trisomías autosómicas raras y aberraciones cromosómicas estructurales, tanto de origen fetal como materno.

Los genetistas clínicos del Centro Médico Erasmus (Rotterdam, Países Bajos) y sus colegas, recolectaron muestras de sangre periférica a las 11 semanas de embarazo y las enviaron a uno de los tres laboratorios de genética clínica que realizan NIPT. La sangre se centrifugó a 1.600 × g durante 10 minutos a 4 °C sin frenos y se aspiró el plasma. Después de un segundo paso de centrifugado durante 10 minutos a 5.600 × g sin frenos, se aisló el ADN libre de células del plasma mediante el uso de kits de ADN circulante QIAsymphony (QIAgen, Venlo, Países Bajos), seguido de la preparación de la biblioteca para la secuenciación superficial del genoma completo. (0,2 × 51 pb de un solo extremo) en el secuenciador HiSeq4000 o NextSeq500 (Illumina, San Diego, CA, EUA).

Los investigadores informaron que más del 43 % de las mujeres eligieron someterse a NIPT y, de ellas, casi las tres cuartas partes optaron por GW-NIPT. En general, se encontró una aneuploidía común entre el 0,49 % de las personas que se sometieron a algún tipo de prueba NIPT. Pero se descubrió un hallazgo adicional en el 0,36 % de las personas que se sometieron a GW-NIPT, lo que significa que 1 de cada 275 mujeres que eligieron GW-NIPT tuvo un resultado que indicaba un hallazgo adicional.

Para alrededor del 10 % de esos casos, los científicos no pudieron determinar el origen de la aberración cromosómica adicional. Pero del resto, casi una cuarta parte fue de origen fetal, mientras que poco más de una cuarta parte fue de origen materno y aproximadamente la mitad se debió a mosaicismo placentario. De las aberraciones cromosómicas de origen fetal, el 77,2 % fueron patógenas. Estas aberraciones incluyeron un puñado de trisomías autosómicas raras, pero la mayoría eran aberraciones cromosómicas estructurales. Los padres optaron por abortos en el 86,9 % de los casos.

Se confirmó o asumió un origen mosaico placentario en el 52,8 % de los casos y, por lo general, se trataba de trisomías autosómicas raras. Aproximadamente la mitad de estos casos se asociaron con resultados perinatales adversos, incluido un mayor riesgo de preeclampsia, parto prematuro y bajo peso al nacer, entre otros. Cerca de dos tercios de las aberraciones cromosómicas de origen materno fueron aberraciones cromosómicas adquiridas, aunque otras fueron CNV constitucionales. Más de la mitad de las mujeres con aberraciones cromosómicas constitucionales tenían síntomas relacionados con la enfermedad que no habían sido diagnosticados previamente. Además, 12 de las 15 aberraciones cromosómicas de origen materno que eran aberraciones complejas se debieron a una neoplasia maligna materna.

Robert-Jan Galjaard, MD, PhD, citogenetista clínico y autor principal del estudio, dijo: "Según la prevalencia conocida de aberraciones cromosómicas graves en los embarazos, esperábamos detectar aberraciones cromosómicas fetales patógenas distintas de las trisomías comunes". Con certeza, vemos el valor agregado de las aberraciones fetales patogénicas adicionales que se detectan con GW-NIPT. La prevalencia de estos hallazgos es similar a la de las trisomías 13 y 18, para las cuales se acepta ampliamente la detección prenatal”.

Los autores concluyeron que la mayoría de los hallazgos adicionales identificados por GW-NIPT tienen un impacto clínico. La mayoría de las aberraciones cromosómicas fetales son patógenas y se asocian con fenotipos clínicos graves. El impacto clínico de los hallazgos maternos se limita predominantemente a las neoplasias malignas maternas. El estudio fue publicado el 2 de junio de 2022 en el American Journal of Human Genetics.

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