Secuenciación del exoma de los recién nacidos localiza errores innatos del metabolismo
Por el equipo editorial de LabMedica en español Actualizado el 26 Aug 2020 |
Imagen: El papel de la secuenciación del exoma en el cribado neonatal de errores congénitos del metabolismo. Valor predictivo positivo bajo y diagnósticos diferenciales complejos del cribado neonatal con EM/EM para la acidemia glutárica-1 (Fotografía cortesía de la Universidad de California en Berkeley).
Los errores innatos del metabolismo (EIM) forman una gran clase de enfermedades genéticas que involucran trastornos congénitos del metabolismo. La mayoría se debe a defectos de genes únicos que codifican enzimas que facilitan la conversión de varios sustratos en otros productos.
Actualmente, se pueden detectar docenas de enfermedades metabólicas congénitas mediante pruebas de cribado en los recién nacidos (NBS), especialmente las pruebas ampliadas que utilizan espectrometría de masas. Esta es una forma cada vez más común de realizar el diagnóstico y, a veces, da como resultado un tratamiento más temprano y un mejor resultado.
Un gran equipo de científicos dirigido por los de la Universidad de California Berkeley (Berkeley, CA, EUA), seleccionó un subconjunto de gotas de sangre seca de 1.200 recién nacidos no identificados para la secuenciación del exoma en las etapas de descubrimiento y validación del estudio. Ese conjunto incluyó a más de 800 recién nacidos con EIM conocidos, junto con 385 bebés que tuvieron resultados de EIM falsos positivos con exámenes de cribado basados en espectrometría de masas en tándem.
El análisis del equipo se centró en 78 genes previamente implicados en cuatro docenas de formas de EIM que se incluyen actualmente en los programas de detección de recién nacidos en California. El proyecto NBSeq evaluó la secuenciación del exoma completo (WES) como una metodología innovadora para realizar la NBS. El equipo descubrió que la estrategia basada en la secuenciación del exoma podría captar EIM auténticos con una sensibilidad del 88%, en comparación con la sensibilidad del 99% con las pruebas basadas en espectrometría de masas en tándem. El brazo de cribado de secuenciación del exoma del estudio descubrió EIM con más del 98% de especificidad, mientras que el método de cribado de espectrometría de masas en tándem establecido tenía una especificidad del 99,8% para detectar los EIM.
La WES por sí sola no era lo suficientemente sensible o específica para ser una forma detección primaria para la mayoría de los EIM mediante NBS. Sin embargo, como prueba secundaria para bebés con exámenes de detección anormales mediante EM/EM, la WES podría reducir los resultados falsos positivos, facilitar la resolución oportuna de casos y, en algunos casos, incluso sugerir un diagnóstico más apropiado o específico que el obtenido inicialmente.
Los autores concluyeron que la secuenciación de los recién nacidos para buscar EIM, proporciona un modelo ideal para evaluar el papel de la secuenciación en el cribado poblacional porque la mayoría son trastornos mendelianos que afectan vías bioquímicas bien entendidas y muchos se han estudiado extensamente. Señalaron que la sensibilidad y la especificidad de la detección basada en secuencias de EIM se pueden comparar directamente con las de la detección actual de EM/EM. El estudio fue publicado el 10 de agosto de 2020 en la revista Nature Medicine.
Enlace relacionado:
Universidad de California Berkeley
Actualmente, se pueden detectar docenas de enfermedades metabólicas congénitas mediante pruebas de cribado en los recién nacidos (NBS), especialmente las pruebas ampliadas que utilizan espectrometría de masas. Esta es una forma cada vez más común de realizar el diagnóstico y, a veces, da como resultado un tratamiento más temprano y un mejor resultado.
Un gran equipo de científicos dirigido por los de la Universidad de California Berkeley (Berkeley, CA, EUA), seleccionó un subconjunto de gotas de sangre seca de 1.200 recién nacidos no identificados para la secuenciación del exoma en las etapas de descubrimiento y validación del estudio. Ese conjunto incluyó a más de 800 recién nacidos con EIM conocidos, junto con 385 bebés que tuvieron resultados de EIM falsos positivos con exámenes de cribado basados en espectrometría de masas en tándem.
El análisis del equipo se centró en 78 genes previamente implicados en cuatro docenas de formas de EIM que se incluyen actualmente en los programas de detección de recién nacidos en California. El proyecto NBSeq evaluó la secuenciación del exoma completo (WES) como una metodología innovadora para realizar la NBS. El equipo descubrió que la estrategia basada en la secuenciación del exoma podría captar EIM auténticos con una sensibilidad del 88%, en comparación con la sensibilidad del 99% con las pruebas basadas en espectrometría de masas en tándem. El brazo de cribado de secuenciación del exoma del estudio descubrió EIM con más del 98% de especificidad, mientras que el método de cribado de espectrometría de masas en tándem establecido tenía una especificidad del 99,8% para detectar los EIM.
La WES por sí sola no era lo suficientemente sensible o específica para ser una forma detección primaria para la mayoría de los EIM mediante NBS. Sin embargo, como prueba secundaria para bebés con exámenes de detección anormales mediante EM/EM, la WES podría reducir los resultados falsos positivos, facilitar la resolución oportuna de casos y, en algunos casos, incluso sugerir un diagnóstico más apropiado o específico que el obtenido inicialmente.
Los autores concluyeron que la secuenciación de los recién nacidos para buscar EIM, proporciona un modelo ideal para evaluar el papel de la secuenciación en el cribado poblacional porque la mayoría son trastornos mendelianos que afectan vías bioquímicas bien entendidas y muchos se han estudiado extensamente. Señalaron que la sensibilidad y la especificidad de la detección basada en secuencias de EIM se pueden comparar directamente con las de la detección actual de EM/EM. El estudio fue publicado el 10 de agosto de 2020 en la revista Nature Medicine.
Enlace relacionado:
Universidad de California Berkeley
Últimas Diagnóstico Molecular noticias
- Analizador de pruebas sindrómicas actualizado permite acceso remoto a resultados de pruebas
- Prueba de PCR para infecciones respiratorias y de garganta detecta múltiples patógenos con síntomas coincidentes
- Técnica de enriquecimiento de ácido nucleico circulante en sangre permite diagnóstico no invasivo del cáncer de hígado
- Primera prueba molecular aprobada por la FDA para detectar malaria en donantes de sangre podría mejorar seguridad del paciente
- Prueba de biomarcadores líquidos detecta enfermedades neurodegenerativas antes de que aparezcan síntomas
- Nuevo método genómico ayuda a diagnosticar pacientes con enfermedad renal inexplicable
- Nuevo hidrogel inteligente allana el camino para nueva "piruleta" para diagnóstico de cáncer de boca
- Prueba de biomarcadores podría mejorar diagnóstico del cáncer de endometrio
- Prueba de ADN en heces de próxima generación supera a PIF en detección del cáncer colorrectal
- Innovador análisis de sangre de pTau217 es tan preciso como imágenes cerebrales o pruebas del LCR para diagnosticar Alzheimer
- Sistema de RT-PCR en el punto de atención de 10 minutos detecta hasta 32 objetivos por muestra
- Células extraídas de orina podrían permitir detección más temprana de enfermedad renal
- Análisis de sangre identifica a personas con mayor riesgo de morir por insuficiencia cardíaca
- Análisis de sangre muestra precisión del 83 % para detectar cáncer colorrectal
- Análisis de sangre podría predecir adultos jóvenes que podrían desarrollar enfermedades del envejecimiento
- Prueba de diagnóstico molecular predice con precisión resultados de terapia en pacientes con cáncer de mama