Se analizan los alelos de riesgo de enfermedad de Alzheimer en las poblaciones latinas
Por el equipo editorial de LabMedica en español Actualizado el 01 Jan 2019 |
Imagen: El Infinium Omni2.5-8 BeadChip ofrece un conjunto óptimo y completo del contenido de los polimorfismos de nucleótido único (SNP) comunes y raros (Fotografía cortesía de Illumina).
El gen de la apolipoproteína E (APOE) codifica tres isoformas comunes conocidas como ε2, ε3 y ε4. Estas están determinadas por dos polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) que producen sustituciones de aminoácidos y cambios funcionales asociados en la proteína.
La isoforma APOε4 se asocia con un aumento de los niveles circulantes de colesterol total y de lipoproteínas de baja densidad (LDL), riesgo cardiovascular, enfermedad de Alzheimer (EA) y demencias relacionadas (ADRD); mientras que APOε2 está asociada con la resistencia cognitiva y la longevidad extendida.
Un equipo de científicos que colaboran con el Centro de Ciencias de la Salud de la Universidad de Texas (Houston, TX, EUA) utilizó una matriz personalizada para genotipificar la APOE en casi 10.900 individuos con ascendencia latina diversa de cuatro áreas metropolitanas en los EUA. Los participantes genotipificados incluyeron representantes de poblaciones centroamericanas, cubanas, dominicanas, mexicanas, puertorriqueñas y sudamericanas, y tenían una edad promedio de poco más de 41 años y un poco más de la mitad de la población objetivo (50,4%) eran mujeres. Se realizó la genotipificación de SNP en todo el genoma en los participantes utilizando un array Illumina personalizado que consiste en el array HumanOmni2.5–8v1–1 (Illumina, San Diego, CA, EUA) junto con un panel de ∼150,000 SNP elegidos por los investigadores.
El equipo descubrió que los individuos dominicanos, puertorriqueños y cubanos tendían a tener frecuencias más altas del bien conocido ADRD y el alelo de riesgo de deterioro cognitivo APOε4. Ese alelo de riesgo APOε4 se encontró con una frecuencia de casi el 18% en los dominicanos, mientras que los cubanos y los puertorriqueños llevaron el alelo a una frecuencia intermedia. Sin embargo, parece ser mucho menos común en las poblaciones individuales de México continental, América Central y América del Sur, que tenían frecuencias de APOε4 de alrededor del 11%.
A la inversa, el equipo descubrió que el alelo APOε2, que se ha propuesto como un factor protector contra el deterioro cognitivo y la ADRD, se encontró en frecuencias mejoradas en individuos de poblaciones latinas del Caribe, inmersos en personas de América Central y apareciendo en las frecuencias más bajas en las poblaciones sudamericanas y mexicanas. El alelo APOε3, la versión más común del alelo APOE en todas las poblaciones humanas analizadas hasta ahora, se encontró en más del 86% de los mexicanos y en casi el 74% de los dominicanos.
Los autores concluyeron que el alelo APOE y las distribuciones de frecuencia de genotipos en una muestra grande y diversa de latinos con antecedentes de ascendencia bien caracterizados. Estos datos proporcionan información valiosa en este grupo étnico poco estudiado y proporcionan la base para futuros estudios de la asociación de APOE con la ADRD en este segmento de rápido crecimiento de la población de los EUA. El estudio fue publicado el 13 de diciembre de 2018 en la revista Scientific Reports.
Enlace relacionado:
Centro de Ciencias de la Salud de la Universidad de Texas
Illumina
La isoforma APOε4 se asocia con un aumento de los niveles circulantes de colesterol total y de lipoproteínas de baja densidad (LDL), riesgo cardiovascular, enfermedad de Alzheimer (EA) y demencias relacionadas (ADRD); mientras que APOε2 está asociada con la resistencia cognitiva y la longevidad extendida.
Un equipo de científicos que colaboran con el Centro de Ciencias de la Salud de la Universidad de Texas (Houston, TX, EUA) utilizó una matriz personalizada para genotipificar la APOE en casi 10.900 individuos con ascendencia latina diversa de cuatro áreas metropolitanas en los EUA. Los participantes genotipificados incluyeron representantes de poblaciones centroamericanas, cubanas, dominicanas, mexicanas, puertorriqueñas y sudamericanas, y tenían una edad promedio de poco más de 41 años y un poco más de la mitad de la población objetivo (50,4%) eran mujeres. Se realizó la genotipificación de SNP en todo el genoma en los participantes utilizando un array Illumina personalizado que consiste en el array HumanOmni2.5–8v1–1 (Illumina, San Diego, CA, EUA) junto con un panel de ∼150,000 SNP elegidos por los investigadores.
El equipo descubrió que los individuos dominicanos, puertorriqueños y cubanos tendían a tener frecuencias más altas del bien conocido ADRD y el alelo de riesgo de deterioro cognitivo APOε4. Ese alelo de riesgo APOε4 se encontró con una frecuencia de casi el 18% en los dominicanos, mientras que los cubanos y los puertorriqueños llevaron el alelo a una frecuencia intermedia. Sin embargo, parece ser mucho menos común en las poblaciones individuales de México continental, América Central y América del Sur, que tenían frecuencias de APOε4 de alrededor del 11%.
A la inversa, el equipo descubrió que el alelo APOε2, que se ha propuesto como un factor protector contra el deterioro cognitivo y la ADRD, se encontró en frecuencias mejoradas en individuos de poblaciones latinas del Caribe, inmersos en personas de América Central y apareciendo en las frecuencias más bajas en las poblaciones sudamericanas y mexicanas. El alelo APOε3, la versión más común del alelo APOE en todas las poblaciones humanas analizadas hasta ahora, se encontró en más del 86% de los mexicanos y en casi el 74% de los dominicanos.
Los autores concluyeron que el alelo APOE y las distribuciones de frecuencia de genotipos en una muestra grande y diversa de latinos con antecedentes de ascendencia bien caracterizados. Estos datos proporcionan información valiosa en este grupo étnico poco estudiado y proporcionan la base para futuros estudios de la asociación de APOE con la ADRD en este segmento de rápido crecimiento de la población de los EUA. El estudio fue publicado el 13 de diciembre de 2018 en la revista Scientific Reports.
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