Genes del asma en adultos son un subconjunto de la enfermedad de inicio en la niñez
Por el equipo editorial de LabMedica en español Actualizado el 13 May 2019 |
Un gran estudio de asociación del genoma relacionado con el asma encontró que los genes implicados en el asma de aparición en adultos eran en gran parte un subconjunto de genes asociados con la enfermedad de inicio en la infancia.
El asma es una enfermedad pulmonar crónica que inflama y estrecha las vías respiratorias. El asma causa periodos recurrentes de sibilancias, opresión en el pecho, dificultad para respirar y tos. La tos a menudo se produce en la noche o temprano en la mañana. El asma afecta a personas de todas las edades, pero con mayor frecuencia comienza durante la infancia. El asma de inicio en la niñez y en el adulto difieren con respecto a la gravedad y los síndromes asociados. No se ha investigado previamente en muestras grandes si también difieren con respecto a los factores de riesgo genéticos.
Por lo tanto, los objetivos de un estudio realizado por investigadores en el Centro Médico de la Universidad de Chicago (IL, EUA), fueron identificar loci de riesgo genético compartido y distinto para el asma de inicio en la niñez y en el adulto, e identificar los genes que podrían mediar los efectos de la variación asociada.
Con este fin, los investigadores llevaron a cabo estudios de todo el genoma amplio y de todo el transcriptoma, con base en datos del Biobanco del Reino Unido, en individuos con asma, incluidos adultos con asma de inicio en la infancia (inicio antes de los 12 años), adultos con inicio en la edad adulta (inicio entre los 26 y 65 años), y adultos sin asma (controles; mayores de 38 años). Además, realizaron estudios de asociación del genoma completo (GWAS, por sus siglas en inglés) para el asma de inicio en la infancia y el asma de inicio en adultos, cada uno en comparación con los controles compartidos.
Los estudios de enriquecimiento determinaron los tejidos en los que los genes en los loci GWAS se expresaban más altamente, y se usó PrediXcan, una prueba basada en transcriptomas de todos los genes, para identificar los genes de riesgo candidatos. PrediXcan analiza directamente los mecanismos moleculares a través de los que la variación genética afecta al fenotipo. El enfoque estima el componente de la expresión génica determinado por el perfil genético de un individuo y correlaciona la expresión génica “imputada” con el fenotipo bajo investigación con el fin de identificar a los genes involucrados en la etiología del fenotipo.
Los investigadores informaron que de 376.358 individuos blancos británicos del Biobanco del Reino Unido, se incluyeron 37.846 con autoinformes de asma diagnosticados por el médico: 9.433 adultos con asma de inicio en la infancia; 21.564 adultos con asma de inicio adulto; y un adicional de 6.849 adultos jóvenes con asma con inicio entre los 12 y 25 años. Para el primer y segundo análisis de GWAS, se utilizaron como controles 318.237 personas mayores de 38 años sin asma.
Los resultados revelaron 61 loci de asma independientes: 23 eran específicos para la infancia, uno era específico para el adulto y 37 se compartieron. De estos loci, 19 se asociaron con la edad de inicio del asma. PrediXcan identificó 113 genes candidatos únicos en 22 de los 61 loci en el GWAS.
Los resultados indicaron que los factores de riesgo genéticos para el asma de inicio en adultos fueron en gran parte un subconjunto del riesgo genético para el asma de inicio en la niñez, pero con efectos en general más pequeños, sugiriendo un mayor papel de los factores de riesgo no genéticos en el asma de inicio en adultos. El establecimiento de la enfermedad en los niños se debió más a los genes de función de la barrera epitelial y la alergia mal regulada, mientras que la causa del asma de aparición en adultos fue más centrada en los pulmones y determinada desde el punto de vista ambiental, pero con mecanismos inmunitarios que conducen a la progresión de la enfermedad tanto en niños como en adultos.
“Este fue el GWAS relacionado con el asma más grande que se haya intentado hasta ahora”, dijo la Dra. Carole Ober, autora colaboradora y profesora de genética humana en la Universidad de Chicago. “Encontramos que los genes involucrados en el asma de aparición en adultos son en gran parte un subconjunto de genes asociados con el asma infantil. Sin embargo, en edades más avanzadas, los mismos genes tienden a tener efectos más pequeños”.
El gran estudio sobre el asma se publicó en la edición digital del 26 de abril de 2019 de la revista Lancet Respiratory Medicine.
Enlace relacionado:
Centro Médico de la Universidad de Chicago
El asma es una enfermedad pulmonar crónica que inflama y estrecha las vías respiratorias. El asma causa periodos recurrentes de sibilancias, opresión en el pecho, dificultad para respirar y tos. La tos a menudo se produce en la noche o temprano en la mañana. El asma afecta a personas de todas las edades, pero con mayor frecuencia comienza durante la infancia. El asma de inicio en la niñez y en el adulto difieren con respecto a la gravedad y los síndromes asociados. No se ha investigado previamente en muestras grandes si también difieren con respecto a los factores de riesgo genéticos.
Por lo tanto, los objetivos de un estudio realizado por investigadores en el Centro Médico de la Universidad de Chicago (IL, EUA), fueron identificar loci de riesgo genético compartido y distinto para el asma de inicio en la niñez y en el adulto, e identificar los genes que podrían mediar los efectos de la variación asociada.
Con este fin, los investigadores llevaron a cabo estudios de todo el genoma amplio y de todo el transcriptoma, con base en datos del Biobanco del Reino Unido, en individuos con asma, incluidos adultos con asma de inicio en la infancia (inicio antes de los 12 años), adultos con inicio en la edad adulta (inicio entre los 26 y 65 años), y adultos sin asma (controles; mayores de 38 años). Además, realizaron estudios de asociación del genoma completo (GWAS, por sus siglas en inglés) para el asma de inicio en la infancia y el asma de inicio en adultos, cada uno en comparación con los controles compartidos.
Los estudios de enriquecimiento determinaron los tejidos en los que los genes en los loci GWAS se expresaban más altamente, y se usó PrediXcan, una prueba basada en transcriptomas de todos los genes, para identificar los genes de riesgo candidatos. PrediXcan analiza directamente los mecanismos moleculares a través de los que la variación genética afecta al fenotipo. El enfoque estima el componente de la expresión génica determinado por el perfil genético de un individuo y correlaciona la expresión génica “imputada” con el fenotipo bajo investigación con el fin de identificar a los genes involucrados en la etiología del fenotipo.
Los investigadores informaron que de 376.358 individuos blancos británicos del Biobanco del Reino Unido, se incluyeron 37.846 con autoinformes de asma diagnosticados por el médico: 9.433 adultos con asma de inicio en la infancia; 21.564 adultos con asma de inicio adulto; y un adicional de 6.849 adultos jóvenes con asma con inicio entre los 12 y 25 años. Para el primer y segundo análisis de GWAS, se utilizaron como controles 318.237 personas mayores de 38 años sin asma.
Los resultados revelaron 61 loci de asma independientes: 23 eran específicos para la infancia, uno era específico para el adulto y 37 se compartieron. De estos loci, 19 se asociaron con la edad de inicio del asma. PrediXcan identificó 113 genes candidatos únicos en 22 de los 61 loci en el GWAS.
Los resultados indicaron que los factores de riesgo genéticos para el asma de inicio en adultos fueron en gran parte un subconjunto del riesgo genético para el asma de inicio en la niñez, pero con efectos en general más pequeños, sugiriendo un mayor papel de los factores de riesgo no genéticos en el asma de inicio en adultos. El establecimiento de la enfermedad en los niños se debió más a los genes de función de la barrera epitelial y la alergia mal regulada, mientras que la causa del asma de aparición en adultos fue más centrada en los pulmones y determinada desde el punto de vista ambiental, pero con mecanismos inmunitarios que conducen a la progresión de la enfermedad tanto en niños como en adultos.
“Este fue el GWAS relacionado con el asma más grande que se haya intentado hasta ahora”, dijo la Dra. Carole Ober, autora colaboradora y profesora de genética humana en la Universidad de Chicago. “Encontramos que los genes involucrados en el asma de aparición en adultos son en gran parte un subconjunto de genes asociados con el asma infantil. Sin embargo, en edades más avanzadas, los mismos genes tienden a tener efectos más pequeños”.
El gran estudio sobre el asma se publicó en la edición digital del 26 de abril de 2019 de la revista Lancet Respiratory Medicine.
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Centro Médico de la Universidad de Chicago
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