Se encuentra un biomarcador fecal novedoso para el cáncer colorrectal
Por el equipo editorial de LabMedica en español Actualizado el 23 Oct 2018 |
Imagen: La LightCycler 480 II es una plataforma de PCR de alto rendimiento y eficiencia media a alta de PCR (Fotografía cortesía de Roche).
El cáncer colorrectal (CCR) es una enfermedad letal que ha aumentado en incidencia durante las últimas décadas, y representa una carga cada vez más importante para el sistema de atención médica en todo el mundo; se ha visto que la disbiosis microbiana intestinal contribuye al desarrollo de esta enfermedad mortal.
Convencionalmente, se han empleado bacterias "beneficiosas" como probióticos en humanos como Lactobacillus (Lb) y Bifidobacterium (Bb), habiendo mostrado efectos anticancerígenos en modelos animales. Faecalibacterium prausnitzii (Fp), la única especie conocida de Faecalibacterium, es un anaerobio comensal antiinflamatorio.
Los científicos de la Universidad Sun Yat-sen (Guangzhou, China) y sus colegas midieron la abundancia relativa de las bacterias, Fusobacterium nucleatum (Fn), Faecalibacterium prausnitzii (Fp), Bifidobacterium (Bb) y Lactobacillus (Lb), mediante la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (PCR) en muestras fecales de dos cohortes de 903 individuos. Los investigadores evaluaron y validaron el desempeño diagnóstico de estas proporciones microbianas e investigaron el efecto antagónico de Fn contra tres cepas indicadoras diferentes.
La cuantificación del gen objetivo y de referencia de los microbiomas (16S rADN universal) se realizó por triplicado en un instrumento LightCycler 480 II (Roche Applied Science, Penzberg, Alemania) utilizando un ensayo basado en SYBR Green (Bio -Rad, Hércules, CA, EUA). La concentración inhibitoria mínima (CIM) de los sobrenadantes de cultivo sin células (SFC) se determinó de acuerdo con el método estándar de microdilución en caldo. Las mediciones de citometría de flujo se realizaron en un citómetro de flujo (Merck, Burlington, MA, EUA).
El equipo informó que la proporción microbiana de Fn a Bb (Fn/Bb) tenía una sensibilidad superior a 84,6% y una especificidad de 92,3% para la detección del CCR (área bajo la curva, AUC = 0,911). La combinación de Fn/Bb y Fn/Fp mejoró el valor de diagnóstico (AUC = 0,943). Además, la combinación de Fn/Bb y de Fn/Fp ofreció una especificidad del 60,0% y una sensibilidad del 90,0% para la detección del CCR en etapa I (AUC = 0,804). En particular, se observó que Fn se correlacionó negativamente con Fp en el grupo de CCR. El desempeño para el diagnóstico del CCR se confirmó en la cohorte de validación II. El sobrenadante de cultivo de Fn exhibió una fuerte actividad bactericida frente a las bacterias probióticas Fp y las cepas de Bb.
Los autores concluyeron que la Fn podría desempeñar un papel en la disbiosis de la microbiota a través de las sustancias antagonistas secretadas contra los probióticos. Además, se pudo identificar la proporción de Fn a los probióticos importantes Fp y Bb como un biomarcador valioso para la detección temprana del CCR. El estudio fue publicado en la edición de septiembre de 2018 de la revista Clinical Chemistry.
Enlace relacionado:
Universidad Sun Yat-sen
Roche Applied Science
Bio-Rad
Merck
Convencionalmente, se han empleado bacterias "beneficiosas" como probióticos en humanos como Lactobacillus (Lb) y Bifidobacterium (Bb), habiendo mostrado efectos anticancerígenos en modelos animales. Faecalibacterium prausnitzii (Fp), la única especie conocida de Faecalibacterium, es un anaerobio comensal antiinflamatorio.
Los científicos de la Universidad Sun Yat-sen (Guangzhou, China) y sus colegas midieron la abundancia relativa de las bacterias, Fusobacterium nucleatum (Fn), Faecalibacterium prausnitzii (Fp), Bifidobacterium (Bb) y Lactobacillus (Lb), mediante la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (PCR) en muestras fecales de dos cohortes de 903 individuos. Los investigadores evaluaron y validaron el desempeño diagnóstico de estas proporciones microbianas e investigaron el efecto antagónico de Fn contra tres cepas indicadoras diferentes.
La cuantificación del gen objetivo y de referencia de los microbiomas (16S rADN universal) se realizó por triplicado en un instrumento LightCycler 480 II (Roche Applied Science, Penzberg, Alemania) utilizando un ensayo basado en SYBR Green (Bio -Rad, Hércules, CA, EUA). La concentración inhibitoria mínima (CIM) de los sobrenadantes de cultivo sin células (SFC) se determinó de acuerdo con el método estándar de microdilución en caldo. Las mediciones de citometría de flujo se realizaron en un citómetro de flujo (Merck, Burlington, MA, EUA).
El equipo informó que la proporción microbiana de Fn a Bb (Fn/Bb) tenía una sensibilidad superior a 84,6% y una especificidad de 92,3% para la detección del CCR (área bajo la curva, AUC = 0,911). La combinación de Fn/Bb y Fn/Fp mejoró el valor de diagnóstico (AUC = 0,943). Además, la combinación de Fn/Bb y de Fn/Fp ofreció una especificidad del 60,0% y una sensibilidad del 90,0% para la detección del CCR en etapa I (AUC = 0,804). En particular, se observó que Fn se correlacionó negativamente con Fp en el grupo de CCR. El desempeño para el diagnóstico del CCR se confirmó en la cohorte de validación II. El sobrenadante de cultivo de Fn exhibió una fuerte actividad bactericida frente a las bacterias probióticas Fp y las cepas de Bb.
Los autores concluyeron que la Fn podría desempeñar un papel en la disbiosis de la microbiota a través de las sustancias antagonistas secretadas contra los probióticos. Además, se pudo identificar la proporción de Fn a los probióticos importantes Fp y Bb como un biomarcador valioso para la detección temprana del CCR. El estudio fue publicado en la edición de septiembre de 2018 de la revista Clinical Chemistry.
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Roche Applied Science
Bio-Rad
Merck
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