Perfil genómico predice riesgo de recaída por subtipo en leucemia pediátrica

La leucemia linfoblástica aguda de células B (LLA-B) es el cáncer infantil más común, y más del 90% de los pacientes sobreviven con los tratamientos modernos. Sin embargo, los resultados son peores cuando la enfermedad reaparece, por lo que es importante una evaluación temprana del riesgo de recaída.

Aunque la subtipificación genética ya ayuda a orientar el tratamiento, predecir la recurrencia en el momento del diagnóstico sigue siendo difícil. Nuevos hallazgos pueden ayudar a aclarar este riesgo al identificar cambios genéticos específicos de cada subtipo en el tumor original que podrían explicar por qué algunos casos reaparecen.

Los científicos de St. Jude Children’s Research Hospital, en colaboración con Seattle Children’s Hospital y el Children’s Oncology Group, evaluaron alteraciones genómicas en la LLA-B pediátrica, centrándose en cambios en el ADN ya presentes en el momento del diagnóstico. Al comparar muestras de leucemia del diagnóstico y de la recaída, identificaron mutaciones asociadas con el riesgo de recaída dentro de subtipos específicos de LLA-B.

El estudio analizó muestras pareadas de ADN del diagnóstico y de la recaída de 183 casos pediátricos de LLA-B. Presentado como el estudio más grande de su tipo, permitió un análisis a nivel de subtipo y mostró que la importancia de una mutación depende del contexto genético más amplio de la leucemia. Las mutaciones asociadas con la recaída fueron específicas de cada subtipo, en lugar de estar vinculadas universalmente a un mayor riesgo en todos los subtipos.

Esta relación fue evidente en el subtipo ETV6::RUNX1, que por lo general tiene un buen pronóstico. Los pacientes cuyo transcrito de fusión unía el exón 5 de ETV6 con el exón 4 de RUNX1 tenían un riesgo de recaída significativamente mayor que aquellos cuyo transcrito de fusión unía el exón 5 de ETV6 con el exón 3 de RUNX1, el transcrito de fusión dominante en este subtipo. Los pacientes con el transcrito de fusión de mayor riesgo también recayeron antes.

Las comparaciones genómicas también mostraron que alrededor del 3% de los casos clasificados clínicamente como recaídas eran biológicamente segundos cánceres no relacionados, en lugar de reapariciones de la leucemia original. Estos casos a veces parecían estar impulsados por una predisposición genética u otros factores. Los hallazgos se publicaron en la revista Blood.

“Verificamos que algunos tumores nacen más resistentes a la terapia convencional. Al identificar las mutaciones de resistencia que ya están presentes en el tumor original, también podríamos haber encontrado una mejor manera de estratificar a los pacientes en tratamientos de mayor intensidad para evitar que esas recaídas lleguen a producirse”, dijo Xiaotu Ma, doctor, autor correspondiente, Departamento de Biología Computacional de St. Jude. 

“Nuestros hallazgos abren la posibilidad de encontrar conocimientos genómicos clínicamente accionables que puedan mejorar y proteger el bienestar de los pacientes desde el diagnóstico inicial. En el futuro, eso puede ayudar a los médicos a prevenir la recaída antes de que comience”, añadió el Dr. Ma.

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St. Jude Children’s Research Hospital
Seattle Children’s Hospital
Children’s Oncology Group