Herramienta simplifica diagnóstico de enfermedades infecciosas

Por el equipo editorial de LabMedica en español
Actualizado el 15 Jun 2016

Se puso a disposición de la comunidad médica una herramienta, basada en Internet, para el diagnóstico de enfermedades infecciosas mediante la rápida interpretación de los datos de secuenciación de ADN.

El software de análisis de metagenómica que impulsa el programa Taxonomer fue desarrollado en la Universidad de Utah (Salt Lake City, EUA). La metagenómica, el análisis genómico de una población de microorganismos, hace posible la elaboración de los perfiles de las comunidades microbianas en el medio ambiente y el cuerpo humano con una profundidad y amplitud sin precedentes. Su uso en rápida expansión está revolucionando la comprensión de la diversidad microbiana en los ambientes naturales y artificiales y está vinculando los perfiles de las comunidades microbianas con la salud y la enfermedad.

El programa Taxonomer es una herramienta ultrarrápida para el análisis integral de los datos metagenómicos y la visualización interactiva de los resultados. Los datos de la secuencia del ADN, de una muestra clínica, son cargados a través de Internet a Taxonomer. En menos de un minuto, la herramienta muestra un inventario, miniatura, de todos los patógenos en la muestra, incluyendo virus, bacterias y hongos. Taxonomer es único en la prestación de la clasificación, basada en proteínas y nucleótidos, integrados, y el análisis simultáneo de los transcritos del ARN mensajero (mARN) del huésped.

Utilizando estudios de casos reales, los desarrolladores mostraron que Taxonomer detecta infecciones previamente no reconocidas y reveló los perfiles de expresión del mARN antiviral, del huésped.

“Nuestros análisis, que se convierten en punto de referencia, muestran que Taxonomer es diez a cien veces más rápido que otras herramientas similares”, dijo el autor principal, el Dr. Robert Schlaberg, profesor asistente de patología clínica en la Universidad de Utah. “Taxonomer proporciona un gran paso adelante, ya que es extremadamente rápido, preciso, y lo suficientemente fácil de usar para su aplicación en los laboratorios de diagnóstico”.

Para facilitar que la comunidad pueda compartir los datos a través de distancias geográficas en las configuraciones de brotes, Taxonomer está disponible al público a través de una interfaz de usuario en la web, en la dirección http://taxonomer.com.

Los resultados del estudio Taxonomer fueron publicados en la edición del 26 de mayo de 2016, de la revista Genome Biology.

Enlaces relacionados:

University of Utah

Taxonomer