Nueva herramienta multiómica ilumina progresión del cáncer

Rastrear cómo los cánceres evolucionan hacia formas más agresivas y resistentes al tratamiento ha sido un desafío para los investigadores desde hace tiempo. Muchas herramientas actuales solo pueden capturar información genética limitada de muestras tumorales, especialmente cuando las muestras están preservadas y no frescas. Una nueva tecnología permite ahora a los científicos registrar múltiples mutaciones genéticas y, al mismo tiempo, rastrear la actividad genética en células cancerosas individuales, lo que proporciona información sin precedentes sobre cómo progresan los cánceres y resisten al tratamiento.

Desarrollada por Weill Cornell Medicine (Nueva York, NY, EUA) en colaboración con la Universidad de Adelaida (Adelaida, Australia), la nueva herramienta, denominada GoT-Multi, es una versión avanzada de la plataforma GoT (Genotipado de Transcriptomas) anterior. Si bien GoT era innovadora, presentaba limitaciones en el número y los tipos de mutaciones que podía detectar, y solo funcionaba con muestras frescas o congeladas. GoT-Multi supera estas barreras, ya que procesa muestras conservadas e incrustadas en cera, un recurso ampliamente disponible en los laboratorios de patología hospitalaria de todo el mundo.

GoT-Multi es una herramienta multiómica unicelular que integra múltiples capas de datos de miles de células cancerosas individuales. Puede procesar grandes conjuntos de muestras rápidamente y vincular la actividad genética celular con mutaciones genéticas, revelando cómo mutaciones específicas impulsan diferentes comportamientos de las células cancerosas, como el crecimiento y la inflamación. Esta funcionalidad ampliada permite a los investigadores mapear la progresión de la enfermedad con una claridad sin precedentes.

En una demostración clave, el equipo aplicó GoT-Multi a muestras de tejido de pacientes cuya leucemia linfocítica crónica había progresado a linfoma agresivo de células B grandes, un proceso conocido como Transformación de Richter. Según los hallazgos publicados en Cell Genomics, la herramienta analizó más de 45.000 células tumorales, identificando más de dos docenas de mutaciones y correlacionándolas con distintas actividades celulares, lo que proporcionó nuevos conocimientos sobre el desarrollo de la malignidad.

Los investigadores utilizan GoT-Multi para estudiar linfomas resistentes a terapias y mapear otros tipos de cáncer y estadios precancerosos. Al vincular datos genéticos y funcionales con resolución unicelular, la herramienta puede descubrir vías clave de resistencia y evolución, lo que podría indicar nuevas dianas terapéuticas. El equipo prevé que esta plataforma guiará el desarrollo de tratamientos de precisión y profundizará en la comprensión de la biología tumoral.

"Esta tecnología nos brinda un poder sustancialmente nuevo para responder preguntas importantes sobre cómo evolucionan los cánceres, desde los inicios de los crecimientos neoplásicos precancerosos hasta la transformación en malignidad y, finalmente, la resistencia a la terapia", dijo la Dra. Anna S. Nam, coautora principal del estudio.

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Weill Cornell Medicine
Universidad de Adelaida