Prueba de ADN en bilis detecta señales tumorales antes del diagnóstico convencional de cáncer

Distinguir las estenosis biliares malignas de las benignas puede ser difícil cuando las muestras de tejido son limitadas o la enfermedad está en una fase temprana. La citología y la biopsia guiadas por colangiopancreatografía retrógrada endoscópica (CPRE) pueden ser inconcluyentes, mientras que el antígeno carbohidrato 19-9 en suero también puede elevarse con la colestasis y la inflamación. Estas limitaciones pueden retrasar el diagnóstico. Para proporcionar una toma de muestras más informativa, nuevos hallazgos muestran que la bilis obtenida durante la CPRE de rutina puede revelar información genómica derivada del tumor.

El estudio evaluó la secuenciación del genoma completo de cobertura ultrabaja (ULP-WGS) del ADN libre de células de la bilis como método para detectar malignidad, clasificar el origen tumoral y apoyar la estratificación pronóstica. El enfoque utilizó 2 ng de ADN libre de células de la bilis secuenciado con una cobertura genómica de aproximadamente 0,2×. Las alteraciones del número de copias a gran escala se identificaron mediante el flujo de trabajo de código abierto ichorCNA, que también estimó la fracción tumoral. Una fracción tumoral de al menos 10% se consideró evidencia de ADN tumoral circulante detectable.

Los investigadores analizaron prospectivamente a 95 pacientes sometidos a su primera CPRE por una estenosis biliar sospechosa en la evaluación radiológica. La anatomía patológica inicial clasificó 26 estenosis como malignas y 69 como indeterminadas. Tras hasta 12 meses de seguimiento, 45 de los casos inicialmente indeterminados se confirmaron como malignos y 24 como benignos. La cohorte maligna final incluyó 40 colangiocarcinomas (CCA) y 31 adenocarcinomas ductales pancreáticos (PDAC).

Entre los pacientes con un diagnóstico anatomopatológico inicial de malignidad, la ULP-WGS de la bilis detectó ADN tumoral en el 73% de los casos. La detección alcanzó el 82% en casos de colangiocarcinoma y el 56% en casos de adenocarcinoma ductal pancreático. Entre las estenosis inicialmente indeterminadas que posteriormente se confirmaron como malignas, la sensibilidad fue del 51%, mientras que 23 de 24 casos finalmente benignos dieron negativo, lo que arrojó una especificidad del 96%. En comparación, el antígeno carbohidrato 19-9 con un umbral de 44 U/mL mostró una especificidad del 53% entre los casos benignos evaluables.

En 23 casos positivos sin malignidad establecida en la primera colangiopancreatografía retrógrada endoscópica, el ADN tumoral se detectó una mediana de 38 días antes del diagnóstico convencional. Un clasificador de alteraciones del número de copias de 50 regiones distinguió el colangiocarcinoma del adenocarcinoma ductal pancreático con una precisión del 86,4% en la cohorte de referencia y del 85,0% en una cohorte de validación. El estudio se publicó en eGastroenterology en 2026. Los autores señalaron que el método no es lo suficientemente sensible como para excluir malignidad cuando el resultado es negativo, pero puede complementar la histopatología tras una toma de muestras inicial inconclusa.