Análisis de ADN en heces monitorea la actividad de la enfermedad en la EII

La enfermedad inflamatoria intestinal (EII) afecta a entre 6 y 8 millones de personas en todo el mundo y se suele monitorizar mediante colonoscopia y análisis de heces. Dado que la actividad de la enfermedad puede fluctuar, los laboratorios necesitan marcadores no invasivos que reflejen la inflamación intestinal en tiempo real.

Tradicionalmente, el ADN humano en las heces se ha considerado un elemento de fondo en lugar de un analito medible. Nuevos hallazgos demuestran que el análisis del origen celular del ADN humano fecal puede ayudar a determinar la actividad de la enfermedad tanto en la EII pediátrica como en la adulta.

Imagen: Utilizando un método que identifica el origen de los fragmentos de ADN, los investigadores encontraron que los niveles de neutrófilos reflejaban estrechamente la gravedad de la inflamación intestinal en pacientes pediátricos y adultos (crédito de la foto: Shutterstock)

Investigadores de la Universidad Hebrea de Jerusalén, junto con el Centro Médico Shaare Zedek, describen un enfoque basado en heces que perfila fragmentos de ADN humano mediante metilación para determinar su origen celular. El análisis muestra que el ADN derivado de neutrófilos domina la señal humana en las heces de pacientes con EII, en lugar del ADN epitelial del colon, como se suponía anteriormente. Al medir explícitamente el ADN del huésped junto con características microbianas, el método proporciona una visión compuesta de la inflamación intestinal.

El estudio, publicado en la revista Microbiome, analizó pacientes pediátricos en Israel y pacientes adultos en los Países Bajos, demostrando resultados consistentes en todas las edades. Los niveles de ADN de neutrófilos en las heces se correlacionaron con marcadores clínicos establecidos, incluida la calprotectina fecal. Los autores también introducen la relación neutrófilos-epitelio (NER), que distingue con mayor eficacia la remisión de la enfermedad activa que la evaluación de cualquiera de los componentes por separado.

Además de correlacionarse con los marcadores actuales, la combinación de señales de ADN humano con datos del microbioma permitió que modelos de aprendizaje automático predijeran la EII y diferenciaran la enfermedad de Crohn de la colitis ulcerosa.

Los investigadores señalan que los ensayos de calprotectina tienen límites de detección que pueden dificultar la evaluación en los casos más graves, mientras que el perfil del ADN del huésped captura la actividad inmunitaria en tiempo real. En conjunto, los hallazgos sugieren una vía hacia el monitoreo longitudinal y no invasivo de los brotes de la enfermedad y la respuesta al tratamiento mediante una simple muestra de heces.

“Durante demasiado tiempo, el ADN humano encontrado en las muestras de heces fue tratado como ‘ruido’ biológico que filtrábamos para centrarnos en los datos microbianos”, dijo el profesor Moran Yassour, de la Universidad Hebrea.

“Nuestros hallazgos demuestran que este ADN contiene información valiosa y hasta ahora desconocida, que refleja la actividad del sistema inmunitario en tiempo real. Al analizar conjuntamente los componentes humanos y microbianos, podemos obtener una visión mucho más clara de lo que ocurre en el intestino.”

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Universidad Hebrea