Mapear proteínas humanas ayudará a identificar enfermedades

Científicos suecos están creando un atlas de las proteínas en los tejidos y células del cuerpo humano. El atlas debe aclarar a los científicos sobre la función de las proteínas y cómo cambios en su distribución se pueden reflejar sobre ciertas enfermedades como el cáncer.

El equipo del atlas de proteínas usa el genoma humano para codificar proteínas individuales. A continuación se desarrollan anticuerpos contra cada una de esas proteínas. El anticuerpo que reconoce una proteína dada es marcado con un marcador para hacerlo visible bajo un microscopio y es expuesto a las muestras de tejidos y células diferentes. El anticuerpo se une a las proteínas y de esta manera, se puede detectar la localización de la proteína.

La genómica funcional describe la manera en la cual los genes y sus productos, las proteínas, interactúan juntas en redes complejas en las células vivas. El Profesor Mathias Uhlén del Instituto de Tecnología Royal (KTH; Estocolmo, Suecia), que está liderando el proyecto, describió el atlas de proteínas humanas durante la Tercera Conferencia de Genómica Funcional de la Fundación Europea de Ciencias en Innsbruck, Austria, del 1 al 4 de octubre de 2008.

El proyecto atlas de proteínas es muy ambicioso. "Hacer esto sistemáticamente requiere una gran automatización y robótica", dijo el Profesor Uhlén. "Tenemos seis ingenieros de software escribiendo códigos solo para rastrear las muestras. El proyecto está generando 400 gigabytes de datos cada día". Hay un equipo de 100 personas trabajando en el proyecto, y pronto se establecerá un sitio en India, y con otros sitios productores de anticuerpos en Corea y China.

El equipo hasta ahora mapeó la localización de aproximadamente 5000 proteínas en células y tejidos humanos. Los científicos están investigando si ciertos cánceres comunes—colon, próstata, pulmón y seno—tienen o no perfiles diferentes de proteínas con respecto al tejido normal. De esta manera, se pueden identificar nuevos biomarcadores, lo que puede alertar a los médicos en los estadíos tempranos de una enfermedad.

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Royal Institute of Technology