Nuevo panel viral permite realizar pruebas simultáneas para el SARS-CoV-2 y los virus respiratorios comunes

Los investigadores han desarrollado un panel viral que permite la prueba simultánea del SARS-CoV-2 junto con numerosos virus respiratorios comunes, que nos dice si otros virus también están en juego en pacientes fuertemente afectados por la COVID.

Esta nueva herramienta de epidemiología genética desarrollada por investigadores de la Universidad de Augusta (Augusta, GA, EUA) junto con Illumina (San Diego, CA, EUA) proporciona información genética detallada sobre los virus presentes cuando se empaqueta con un modelo de inmunología molecular llamado Nextstrain. También permite a los investigadores evaluar las nuevas variantes virales que están circulando en un estado o nación y los patrones de su propagación con el objetivo de ayudar a predecir y mitigar futuros brotes.

Imagen: Dr. Ravindra Kolhe (Fotografía cortesía de la Universidad de Augusta)

Los investigadores desarrollaron un panel de 41 virus que incluye cuatro coronavirus humanos comunes que han estado causando resfriados en las personas durante años, así como el SARS-CoV-2, y otros jugadores como el VSR, virus sincitial respiratorio, que también causa un resfriado leve típico y más de una docena de virus de influenza. Las pruebas estándar de SARS-CoV-2 utilizan la reacción en cadena de la polimerasa, o PCR, que puede indicarle si el virus está presente, pero la técnica que están usando para el panel en realidad secuencia el genoma viral que permite la detección de variantes. También detalla los cambios en la región conservada más grande del virus que ocurren esencialmente cada vez que se multiplica, lo que indica que ha encontrado un organismo huésped, como un ser humano. Si bien esos pequeños cambios en la región conservada del virus no afectan el resultado clínico, brindan una especie de sello genómico del origen del virus.

La firma molecular única también es una forma de saber qué casos no están conectados. El modelo de visualización interactiva que utilizan para observar la propagación viral también puede rastrear el movimiento de variantes, como Delta, que tienen consecuencias clínicas directas como el grado de contagio y la enfermedad resultante. Parte del movimiento humano puede ocurrir antes de que el individuo se dé cuenta de que es positivo. Es importante saber con precisión qué virus están presentes porque, si bien hay algo en común entre los virus respiratorios, los tratamientos tienden a ser diferentes, pero no hay muchos datos cruzados sobre cuánto hasta la fecha. El nuevo estudio muestra que la epidemiología genómica es esencial para predecir la transmisión de enfermedades y los patrones de transmisión, incluido el potencial para reconocer un probable resurgimiento.

"Nos preocupa que, debido a que la mayoría de nosotros ya no usamos máscaras o distanciamiento social y en su mayoría hemos reanudado nuestros horarios normales, una consecuencia será más coinfecciones", dijo el Dr. Ravindra Kolhe, director del Laboratorio Esotérico y Molecular de Georgia, o GEM Lab, en la Facultad de Medicina de Georgia en la Universidad de Augusta. "Creemos que esta es una buena herramienta para tenerla lista cuando llegue la temporada de resfriados y la gripe".

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